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发布时间:2026-10-21 | 浏览:1
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DOI: 10.13344/j.microbiol.china.265000 CSTR: 32113.14.j.MC.265000 人体微生物组研究正由群落组成描述向多维微生态状态刻画、机制解析、因果推断及临床转化不断深入。随着绝对定量、菌株分辨率、多菌界分析、纵向研究和多组学整合的发展,如何准确测量微生态状态、控制宿主与环境混杂因素、建立微生物功能输出与宿主表型之间的机制证据,并检验其临床效用,已成为该领域的关键问题。本期《微生物学通报》“人体微生物组”主题专栏组织14篇文章,涵盖定量与标准化、菌株遗传变异与多菌界生态、跨生态位微生物传播、宿主-微生物互作、个体异质性及微生态干预等方向。本文以“测量-归因-机制/因果-效用”为主线,概述人体微生物组研究从群落图谱走向机制解析与精准干预的发展趋势与关键挑战。 重大慢病肠道微生物组检测的规范化及临床应用专家共识 2026,53(10):5097-5115, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260190 CSTR: 32113.14.j.MC.260190 摘要: (4) HTML (3) PDF (1001.33 K)( 2 ) Abstract: 肠道微生物组作为人体关键的“微生物器官”,其结构及功能稳态与多种重大慢性疾病的发生发展密切相关。随着高通量测序技术的日益成熟与标准化,肠道微生物组检测在疾病风险评估、辅助诊断、疗效监测及肠菌移植(fecal microbiota transplantation, FMT)个体化应用等方面展现出较好的临床应用潜力。为推进该检测的规范化应用,本共识专家组系统梳理国内外文献、整合最新临床研究证据及多家检测机构的实践经验,经多轮研讨与修订,最终形成本共识。本共识明确了肠道微生物组检测的技术路径、样本采集和管理规范、实验室建设、质量控制体系以及临床报告解读标准,并确立了其在重大慢性疾病风险预测以及评估FMT对肠道微生物组重塑等方面的重要作用,旨在为医疗机构、临床医师及相关从业人员提供标准化操作指南,推动该检测技术在临床应用中更加科学、规范与精准。 2026,53(10):5097-5115, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260190 CSTR: 32113.14.j.MC.260190 肠道微生物组作为人体关键的“微生物器官”,其结构及功能稳态与多种重大慢性疾病的发生发展密切相关。随着高通量测序技术的日益成熟与标准化,肠道微生物组检测在疾病风险评估、辅助诊断、疗效监测及肠菌移植(fecal microbiota transplantation, FMT)个体化应用等方面展现出较好的临床应用潜力。为推进该检测的规范化应用,本共识专家组系统梳理国内外文献、整合最新临床研究证据及多家检测机构的实践经验,经多轮研讨与修订,最终形成本共识。本共识明确了肠道微生物组检测的技术路径、样本采集和管理规范、实验室建设、质量控制体系以及临床报告解读标准,并确立了其在重大慢性疾病风险预测以及评估FMT对肠道微生物组重塑等方面的重要作用,旨在为医疗机构、临床医师及相关从业人员提供标准化操作指南,推动该检测技术在临床应用中更加科学、规范与精准。 肿瘤组织微生物鉴定方法及其研究挑战 陶丽雯,盛韫哲,焦娜,朱瑞新 2026,53(10):5116-5132, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260285 CSTR: 32113.14.j.MC.260285 摘要: (1) HTML (3) PDF (1.51 M)( 2 ) Abstract: 肿瘤组织微生物作为肿瘤微环境的重要组成部分,其存在性与生物学意义近年来在高通量测序与原位成像技术的推动下逐渐获得证据支持,研究重点也由存在性验证转向组成特征、空间定位、宿主互作及功能机制的系统解析。然而,肿瘤组织通常属于低生物量样本,并且伴随高比例宿主核酸背景和显著污染风险,使得微生物信号的可靠鉴定面临特殊的方法学挑战。本文围绕肿瘤组织微生物鉴定的关键技术路线进行综述,重点概述原位检测与空间定位方法、针对微生物组的测序策略,以及基于宿主测序数据的微生物信号挖掘方法,并系统讨论低生物量场景下的污染控制、宿主去除、数据库质量控制、批次校正和独立验证等问题。进一步地,本文强调基于宿主测序数据的微生物鉴定策略,因其能够在保留组织原生信息的同时并行获取宿主与微生物特征,为解析宿主与微生物原位互作提供了重要的技术支撑。结合近年来泛癌公共数据重分析所引发的方法学争议,本文进一步讨论原始测序数据公开、分析流程透明和跨队列复现验证在提高研究可信度中的重要作用,并在系统梳理当前核心挑战的基础上,从实验标准化、计算基准化、功能验证体系完善和多模态整合建模等方面提出应对策略,以推动肿瘤组织微生物研究由相关性描述走向机制解释与临床转化。 1 2 2026,53(10):5116-5132, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260285 CSTR: 32113.14.j.MC.260285 肿瘤组织微生物作为肿瘤微环境的重要组成部分,其存在性与生物学意义近年来在高通量测序与原位成像技术的推动下逐渐获得证据支持,研究重点也由存在性验证转向组成特征、空间定位、宿主互作及功能机制的系统解析。然而,肿瘤组织通常属于低生物量样本,并且伴随高比例宿主核酸背景和显著污染风险,使得微生物信号的可靠鉴定面临特殊的方法学挑战。本文围绕肿瘤组织微生物鉴定的关键技术路线进行综述,重点概述原位检测与空间定位方法、针对微生物组的测序策略,以及基于宿主测序数据的微生物信号挖掘方法,并系统讨论低生物量场景下的污染控制、宿主去除、数据库质量控制、批次校正和独立验证等问题。进一步地,本文强调基于宿主测序数据的微生物鉴定策略,因其能够在保留组织原生信息的同时并行获取宿主与微生物特征,为解析宿主与微生物原位互作提供了重要的技术支撑。结合近年来泛癌公共数据重分析所引发的方法学争议,本文进一步讨论原始测序数据公开、分析流程透明和跨队列复现验证在提高研究可信度中的重要作用,并在系统梳理当前核心挑战的基础上,从实验标准化、计算基准化、功能验证体系完善和多模态整合建模等方面提出应对策略,以推动肿瘤组织微生物研究由相关性描述走向机制解释与临床转化。 结直肠癌肠道多菌界微生态失衡及菌株层级变异 李季璇,左倩文,朱瑞新,赵国屏,焦娜 2026,53(10):5133-5152, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260449 CSTR: 32113.14.j.MC.260449 摘要: (1) HTML (2) PDF (1.99 M)( 1 ) Abstract: 肠道微生物组深刻参与结直肠癌(colorectal cancer, CRC)的发生发展。近年来,CRC相关肠道微生态研究已从单一的“物种丰度改变”,转向涵盖群落结构、多菌界互作、菌株层级遗传变异及功能重塑的多维度解析。具体而言,CRC微生态异常不仅表现在细菌群落失衡及口源菌的异位定殖,还伴随古菌、真菌和病毒等跨界成员的广泛参与。同时,单核苷酸变异(single nucleotide variants, SNVs)、插入缺失(insertions and deletions, InDels)、结构变异(structural variants, SVs)、拷贝数变异(copy number variants, CNVs)和水平基因转移(horizontal gene transfer, HGT)等菌株层级的基因异质性,被认为是塑造特定微生物致癌潜能差异的重要遗传基础。在功能层面,微生物来源分子、代谢重塑及微生物与宿主信号互作,共同调节了CRC的病理进程。但相关研究仍面临因果关系不清、时间序列缺失、混杂因素干扰等挑战。未来应结合因果推断、纵向队列、匹配设计等策略,推动CRC微生态研究从相关性描述走向因果机制解析,并促进微生物标志物和靶向干预策略的临床转化。本文梳理了CRC微生态多维度重构的研究进展,旨在为构建从“关联性挖掘”到“机制解析”再到“精准临床转化”的研究框架提供理论参考。 1 2 3 李季璇,左倩文,朱瑞新,赵国屏,焦娜 2026,53(10):5133-5152, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260449 CSTR: 32113.14.j.MC.260449 肠道微生物组深刻参与结直肠癌(colorectal cancer, CRC)的发生发展。近年来,CRC相关肠道微生态研究已从单一的“物种丰度改变”,转向涵盖群落结构、多菌界互作、菌株层级遗传变异及功能重塑的多维度解析。具体而言,CRC微生态异常不仅表现在细菌群落失衡及口源菌的异位定殖,还伴随古菌、真菌和病毒等跨界成员的广泛参与。同时,单核苷酸变异(single nucleotide variants, SNVs)、插入缺失(insertions and deletions, InDels)、结构变异(structural variants, SVs)、拷贝数变异(copy number variants, CNVs)和水平基因转移(horizontal gene transfer, HGT)等菌株层级的基因异质性,被认为是塑造特定微生物致癌潜能差异的重要遗传基础。在功能层面,微生物来源分子、代谢重塑及微生物与宿主信号互作,共同调节了CRC的病理进程。但相关研究仍面临因果关系不清、时间序列缺失、混杂因素干扰等挑战。未来应结合因果推断、纵向队列、匹配设计等策略,推动CRC微生态研究从相关性描述走向因果机制解析,并促进微生物标志物和靶向干预策略的临床转化。本文梳理了CRC微生态多维度重构的研究进展,旨在为构建从“关联性挖掘”到“机制解析”再到“精准临床转化”的研究框架提供理论参考。 肠道菌群在饮食和药物干预肥胖及 2 型糖尿病中的机制与应用展望 宋德磊,张晨虹 2026,53(10):5153-5168, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260444 CSTR: 32113.14.j.MC.260444 摘要: (1) HTML (3) PDF (1.15 M)( 1 ) Abstract: 肥胖与2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus, T2DM)已发展成为全球范围内亟待解决的重大公共卫生问题,饮食干预和药物治疗是当前改善此类患者病理状态的核心手段。大量研究表明,肠道菌群不仅在肥胖与T2DM的发生发展中发挥因果作用,更是决定饮食与药物干预异质性(响应与不响应)的主动调控者。本文系统梳理了“饮食-药物-菌群-代谢”轴在肥胖及T2DM中的交互机制。一方面,膳食营养和药物通过干预菌群的代谢通路(如短链脂肪酸发酵、次级胆汁酸转化、支链氨基酸降解等)来重塑机体代谢稳态;另一方面,肠道菌群可通过底物竞争、酶促降解及局部免疫调节等机制,对干预效果发挥双向调控作用。深入探讨肠道菌群在上述过程中发挥的作用,并将其作为预测干预响应度的生物标志物,将为肥胖与T2DM的个性化精准医疗提供关键突破口。 1 2026,53(10):5153-5168, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260444 CSTR: 32113.14.j.MC.260444 肥胖与2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus, T2DM)已发展成为全球范围内亟待解决的重大公共卫生问题,饮食干预和药物治疗是当前改善此类患者病理状态的核心手段。大量研究表明,肠道菌群不仅在肥胖与T2DM的发生发展中发挥因果作用,更是决定饮食与药物干预异质性(响应与不响应)的主动调控者。本文系统梳理了“饮食-药物-菌群-代谢”轴在肥胖及T2DM中的交互机制。一方面,膳食营养和药物通过干预菌群的代谢通路(如短链脂肪酸发酵、次级胆汁酸转化、支链氨基酸降解等)来重塑机体代谢稳态;另一方面,肠道菌群可通过底物竞争、酶促降解及局部免疫调节等机制,对干预效果发挥双向调控作用。深入探讨肠道菌群在上述过程中发挥的作用,并将其作为预测干预响应度的生物标志物,将为肥胖与T2DM的个性化精准医疗提供关键突破口。 孤独症谱系障碍肠道微生物组:异质性、功能变异与精准分层 李辉,王新军,陈婉宁,赵晨浩,朱立新,秦环龙,朱瑞新 2026,53(10):5169-5185, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260718 CSTR: 32113.14.j.MC.260718 摘要: (1) HTML (3) PDF (1.96 M)( 1 ) Abstract: 孤独症谱系障碍(autism spectrum disorder, ASD)是一种高度异质的神经发育疾病。肠道微生物组作为连接外周环境与中枢神经系统的重要调制层,其在ASD病理生理和干预响应差异中的作用受到广泛关注。然而,不同研究报告的微生物组改变差异显著。这种不一致并不只是方法学问题,也与饮食、共病、家庭共享背景以及药物和环境暴露等异质性因素密切相关。尤其是胃肠道症状、免疫代谢异常、睡眠问题和焦虑等共病既可能构成混杂,也可作为连接微生物组变化、宿主功能状态和干预响应的重要表型轴。在此基础上,功能层和基因组变异层证据可能比单纯分类学差异更有助于提高解释力和跨队列稳定性。本文首先系统阐述ASD肠道微生物组异质性的主要来源,并重点讨论研究重点由分类学层向功能层和基因组变异层的拓展。随后,从神经发育、神经免疫、代谢调控和因果证据4个维度,分析肠道微生物组与ASD相关神经发育机制之间的联系。最后,提出应整合饮食、共病、微生物组及多组学特征开展精准分层,并在此基础上探索肠道微生态干预。未来需要通过标准化研究设计、严格混杂控制、多组学整合和分层验证,进一步提高ASD肠道微生物组研究的机制解释力和临床转化可行性。 1 2 3 李辉,王新军,陈婉宁,赵晨浩,朱立新,秦环龙,朱瑞新 2026,53(10):5169-5185, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260718 CSTR: 32113.14.j.MC.260718 孤独症谱系障碍(autism spectrum disorder, ASD)是一种高度异质的神经发育疾病。肠道微生物组作为连接外周环境与中枢神经系统的重要调制层,其在ASD病理生理和干预响应差异中的作用受到广泛关注。然而,不同研究报告的微生物组改变差异显著。这种不一致并不只是方法学问题,也与饮食、共病、家庭共享背景以及药物和环境暴露等异质性因素密切相关。尤其是胃肠道症状、免疫代谢异常、睡眠问题和焦虑等共病既可能构成混杂,也可作为连接微生物组变化、宿主功能状态和干预响应的重要表型轴。在此基础上,功能层和基因组变异层证据可能比单纯分类学差异更有助于提高解释力和跨队列稳定性。本文首先系统阐述ASD肠道微生物组异质性的主要来源,并重点讨论研究重点由分类学层向功能层和基因组变异层的拓展。随后,从神经发育、神经免疫、代谢调控和因果证据4个维度,分析肠道微生物组与ASD相关神经发育机制之间的联系。最后,提出应整合饮食、共病、微生物组及多组学特征开展精准分层,并在此基础上探索肠道微生态干预。未来需要通过标准化研究设计、严格混杂控制、多组学整合和分层验证,进一步提高ASD肠道微生物组研究的机制解释力和临床转化可行性。 长寿人群的肠道微生物组特征、机制及资源挖掘研究进展 张钦任,郑钜圣 2026,53(10):5186-5203, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260355 CSTR: 32113.14.j.MC.260355 摘要: (1) HTML (3) PDF (1.32 M)( 1 ) Abstract: 为探讨长寿人群肠道微生物组特征及其临床转化潜力,本文系统检索国内外长寿人群队列相关文献,整合队列研究现状、肠道微生物组、代谢通路及衍生代谢物等证据。结果显示,长寿老人肠道微生物组呈现显著的“年轻化”特征:α多样性升高,有益菌富集,代谢通路重定向产生抗炎抗氧化代谢物,真菌菌群与细菌协同变化。长寿来源益生菌在动物模型中展现出改善认知、抗炎及修复肠道屏障的潜力。综上,与既往侧重普遍衰老机制或单一菌群的综述不同,本文基于国内外多队列横向比较,揭示了长寿人群肠道微生物组的保护性特征,提出了从关联到因果验证再到临床转化的研究范式,并首次将真菌菌群纳入长寿人群微生物组的综述框架,从代谢网络互作的角度,阐释了短链脂肪酸、次级胆汁酸、抗氧化代谢物与氨基酸衍生分子形成的保护性代谢重编程网络。未来需加强纵向多组学整合分析、发挥中国大样本队列优势、结合人工智能辅助筛选,以加速长寿源益生菌的临床转化与个性化干预。 1 2 2026,53(10):5186-5203, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260355 CSTR: 32113.14.j.MC.260355 为探讨长寿人群肠道微生物组特征及其临床转化潜力,本文系统检索国内外长寿人群队列相关文献,整合队列研究现状、肠道微生物组、代谢通路及衍生代谢物等证据。结果显示,长寿老人肠道微生物组呈现显著的“年轻化”特征:α多样性升高,有益菌富集,代谢通路重定向产生抗炎抗氧化代谢物,真菌菌群与细菌协同变化。长寿来源益生菌在动物模型中展现出改善认知、抗炎及修复肠道屏障的潜力。综上,与既往侧重普遍衰老机制或单一菌群的综述不同,本文基于国内外多队列横向比较,揭示了长寿人群肠道微生物组的保护性特征,提出了从关联到因果验证再到临床转化的研究范式,并首次将真菌菌群纳入长寿人群微生物组的综述框架,从代谢网络互作的角度,阐释了短链脂肪酸、次级胆汁酸、抗氧化代谢物与氨基酸衍生分子形成的保护性代谢重编程网络。未来需加强纵向多组学整合分析、发挥中国大样本队列优势、结合人工智能辅助筛选,以加速长寿源益生菌的临床转化与个性化干预。 膳食糖和代糖对口腔微生物组的影响 龙倬伟,戴磊 2026,53(10):5204-5223, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260471 CSTR: 32113.14.j.MC.260471 摘要: (1) HTML (2) PDF (1.79 M)( 1 ) Abstract: 口腔微生物组作为人体第二大复杂共生群落,已发现逾700种原核生物,其生态平衡是维持口腔及全身健康的核心。根据Marsh提出的生态菌斑假说,口腔疾病并非源于特定致病菌的单纯入侵,而是源于饮食等环境因素改变导致的微生物群落生态失衡。在这一理论框架下,膳食碳水化合物作为影响最显著的环境暴露因素之一,通过改变口腔生物膜的底物可获得性,驱动微生物群落从共生状态向产酸耐酸性表型转变。频繁摄入蔗糖等可发酵糖可显著降低菌群多样性,富集变异链球菌( Streptococcus mutans )等产酸菌,并介导细菌与真菌的跨界协同,形成具有物理抗性的复杂生物膜,最终导致釉质脱矿和龋病发生。本文从生态菌斑假说出发,综述膳食糖及各类代糖对口腔微生物组的影响,阐述其塑造微生物生态的规律及以微生物为中介对口腔健康的影响,并指出现有证据的局限与未来方向。 1 2 2026,53(10):5204-5223, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260471 CSTR: 32113.14.j.MC.260471 口腔微生物组作为人体第二大复杂共生群落,已发现逾700种原核生物,其生态平衡是维持口腔及全身健康的核心。根据Marsh提出的生态菌斑假说,口腔疾病并非源于特定致病菌的单纯入侵,而是源于饮食等环境因素改变导致的微生物群落生态失衡。在这一理论框架下,膳食碳水化合物作为影响最显著的环境暴露因素之一,通过改变口腔生物膜的底物可获得性,驱动微生物群落从共生状态向产酸耐酸性表型转变。频繁摄入蔗糖等可发酵糖可显著降低菌群多样性,富集变异链球菌( Streptococcus mutans )等产酸菌,并介导细菌与真菌的跨界协同,形成具有物理抗性的复杂生物膜,最终导致釉质脱矿和龋病发生。本文从生态菌斑假说出发,综述膳食糖及各类代糖对口腔微生物组的影响,阐述其塑造微生物生态的规律及以微生物为中介对口腔健康的影响,并指出现有证据的局限与未来方向。 肠道菌群菌株水平遗传变异及多界微生物互作在代谢功能障碍相关脂肪性肝病中的作用 周小锋,罗春杉,郑琰 2026,53(10):5224-5234, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260451 CSTR: 32113.14.j.MC.260451 摘要: (1) HTML (2) PDF (1.77 M)( 1 ) Abstract: 代谢功能障碍相关脂肪性肝病(metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease, MASLD)是全球最常见的慢性肝病之一,其发生发展与肠道微生态失衡密切相关。既往研究多从物种水平描述肠道菌群组成变化,虽揭示了菌群失衡与MASLD之间的关联,但难以解释同一物种内部的功能差异及不同研究结果的不一致性。随着宏基因组测序和菌株分辨率分析技术的发展,肠道菌群研究正由“物种丰度变化”逐步深入到“菌株功能异质性”及其遗传基础。现有研究提示,单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)和结构变异(structural variations, SVs)可通过影响基因功能、促进功能基因簇获得或缺失以及重塑代谢通路,决定菌株的功能潜力,并参与胆汁酸代谢、能量代谢和炎症反应等MASLD相关过程。与此同时,肠道微生态系统由细菌、噬菌体、真菌等多界微生物共同构成,不同类群之间的互作可进一步影响菌株功能的表达、传播和放大,从而在群落层面调控宿主代谢稳态。因此,MASLD相关微生物功能异常不应仅从物种丰度变化加以理解,而应纳入菌株遗传变异与多界微生物互作的整合框架。本文围绕“遗传变异-菌株功能潜力-多界互作-宿主代谢”这一主线,综述菌株水平遗传变异及多界微生物互作在MASLD中的研究进展,分析当前研究在证据层级、因果关系解析、关键功能变异识别及多组学整合方面的挑战,并展望基于菌株特异性功能和微生态调控网络的精准干预策略,以期为MASLD机制研究和临床转化提供新的思路。 1 2 2026,53(10):5224-5234, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260451 CSTR: 32113.14.j.MC.260451 代谢功能障碍相关脂肪性肝病(metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease, MASLD)是全球最常见的慢性肝病之一,其发生发展与肠道微生态失衡密切相关。既往研究多从物种水平描述肠道菌群组成变化,虽揭示了菌群失衡与MASLD之间的关联,但难以解释同一物种内部的功能差异及不同研究结果的不一致性。随着宏基因组测序和菌株分辨率分析技术的发展,肠道菌群研究正由“物种丰度变化”逐步深入到“菌株功能异质性”及其遗传基础。现有研究提示,单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)和结构变异(structural variations, SVs)可通过影响基因功能、促进功能基因簇获得或缺失以及重塑代谢通路,决定菌株的功能潜力,并参与胆汁酸代谢、能量代谢和炎症反应等MASLD相关过程。与此同时,肠道微生态系统由细菌、噬菌体、真菌等多界微生物共同构成,不同类群之间的互作可进一步影响菌株功能的表达、传播和放大,从而在群落层面调控宿主代谢稳态。因此,MASLD相关微生物功能异常不应仅从物种丰度变化加以理解,而应纳入菌株遗传变异与多界微生物互作的整合框架。本文围绕“遗传变异-菌株功能潜力-多界互作-宿主代谢”这一主线,综述菌株水平遗传变异及多界微生物互作在MASLD中的研究进展,分析当前研究在证据层级、因果关系解析、关键功能变异识别及多组学整合方面的挑战,并展望基于菌株特异性功能和微生态调控网络的精准干预策略,以期为MASLD机制研究和临床转化提供新的思路。 微生物组和肿瘤免疫治疗 周海燕,朱虹,聂小群,杨琛 2026,53(10):5235-5252, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260297 CSTR: 32113.14.j.MC.260297 摘要: (1) HTML (2) PDF (1.12 M)( 2 ) Abstract: 越来越多的研究表明,微生物组作为“人体第二基因组”,其组成和功能影响肿瘤免疫治疗疗效,因此成为一个极具前景的治疗靶点。然而,微生物组靶向干预肿瘤免疫治疗疗效有限,部分原因是个体间的微生物异质性。因此,迫切地需要开发新的靶向干预策略,以提高免疫治疗疗效。本文综述了微生物组和肿瘤免疫治疗的相关研究进展与目前面临的挑战,以及未来的研究方向,旨在为推动微生物组干预从基础研究向临床转化应用提供启示。 1 2 2026,53(10):5235-5252, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260297 CSTR: 32113.14.j.MC.260297 越来越多的研究表明,微生物组作为“人体第二基因组”,其组成和功能影响肿瘤免疫治疗疗效,因此成为一个极具前景的治疗靶点。然而,微生物组靶向干预肿瘤免疫治疗疗效有限,部分原因是个体间的微生物异质性。因此,迫切地需要开发新的靶向干预策略,以提高免疫治疗疗效。本文综述了微生物组和肿瘤免疫治疗的相关研究进展与目前面临的挑战,以及未来的研究方向,旨在为推动微生物组干预从基础研究向临床转化应用提供启示。 肠道菌群-肠内分泌细胞轴:糖尿病代谢调控的新视角 刘芝羽,贾洋洋,顾燕云 2026,53(10):5253-5271, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260370 CSTR: 32113.14.j.MC.260370 摘要: (1) HTML (3) PDF (1.60 M)( 1 ) Abstract: 肠道菌群与肠内分泌细胞(enteroendocrine cells, EECs)之间的相互作用轴(“肠道菌群-EECs轴”)在糖尿病发生发展中发挥关键作用。本文系统综述了该轴在代谢调控中的双重基石作用、糖尿病状态下的功能紊乱机制,以及基于此轴的干预策略研究进展。本文系统阐述了包括L、K、EC、I、A、D等多种内分泌细胞亚型在内的复杂交互网络,并深入分析了菌群基于“空间定位-代谢物-特异受体-胞内通路”这一关键轴线对糖尿病(包括1型糖尿病、2型糖尿病及妊娠期糖尿病)的潜在调控机制。研究表明,菌群代谢产物(如短链脂肪酸、胆汁酸)通过特异性受体调控EECs激素分泌,维持血糖稳态;在糖尿病状态下,菌群失调与EECs功能紊乱相互交织,通过信号通路失衡与慢性炎症推动胰岛素抵抗与β细胞功能障碍。当前研究正从菌群组成分析向功能分子与信号机制深入,饮食干预、益生菌、粪菌移植及工程菌、受体激动剂等靶向策略展现出潜力,但仍面临疗效个体差异大、安全性待验证等挑战。未来应聚焦关键代谢物-受体通路的机制解析,结合多组学与个体化策略,推动基于“菌群-EECs轴”的精准治疗发展。 1 2026,53(10):5253-5271, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260370 CSTR: 32113.14.j.MC.260370 肠道菌群与肠内分泌细胞(enteroendocrine cells, EECs)之间的相互作用轴(“肠道菌群-EECs轴”)在糖尿病发生发展中发挥关键作用。本文系统综述了该轴在代谢调控中的双重基石作用、糖尿病状态下的功能紊乱机制,以及基于此轴的干预策略研究进展。本文系统阐述了包括L、K、EC、I、A、D等多种内分泌细胞亚型在内的复杂交互网络,并深入分析了菌群基于“空间定位-代谢物-特异受体-胞内通路”这一关键轴线对糖尿病(包括1型糖尿病、2型糖尿病及妊娠期糖尿病)的潜在调控机制。研究表明,菌群代谢产物(如短链脂肪酸、胆汁酸)通过特异性受体调控EECs激素分泌,维持血糖稳态;在糖尿病状态下,菌群失调与EECs功能紊乱相互交织,通过信号通路失衡与慢性炎症推动胰岛素抵抗与β细胞功能障碍。当前研究正从菌群组成分析向功能分子与信号机制深入,饮食干预、益生菌、粪菌移植及工程菌、受体激动剂等靶向策略展现出潜力,但仍面临疗效个体差异大、安全性待验证等挑战。未来应聚焦关键代谢物-受体通路的机制解析,结合多组学与个体化策略,推动基于“菌群-EECs轴”的精准治疗发展。 口腔-肠道菌群轴对疾病发生发展的影响 刘雪帆,郅敏 2026,53(10):5272-5291, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260533 CSTR: 32113.14.j.MC.260533 摘要: (1) HTML (3) PDF (1.22 M)( 1 ) Abstract: 近些年来,随着人体微生物组学快速发展,人体是与数万亿微生物互利共生形成的复杂生态系统成为共识。而口腔与肠道是微生物群落存在的两大主要场所,虽然两者在解剖结构上明显不同,但二者通过消化道相通,可以相互影响。越来越多的研究观察到多种疾病中存在口腔-肠道菌群轴的紊乱,促使科学家们对口腔-肠道菌群轴与各种疾病的关系进行深入研究。然而,由于种种局限,口腔-肠道菌群轴紊乱与各种疾病发生发展的因果关系不能确定。本文对口腔-肠道菌群轴的传播途径进行了总结,探讨了该轴与口腔疾病、炎症性肠病、结直肠癌、神经退行性疾病、代谢性疾病、心血管疾病及自身免疫性疾病等多种疾病的关联及相关作用机制,为未来口腔-肠道菌群轴紊乱与各种疾病关系的研究方向提供了参考,也为相关疾病诊断和治疗提供了新的思路。 1 2026,53(10):5272-5291, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260533 CSTR: 32113.14.j.MC.260533 近些年来,随着人体微生物组学快速发展,人体是与数万亿微生物互利共生形成的复杂生态系统成为共识。而口腔与肠道是微生物群落存在的两大主要场所,虽然两者在解剖结构上明显不同,但二者通过消化道相通,可以相互影响。越来越多的研究观察到多种疾病中存在口腔-肠道菌群轴的紊乱,促使科学家们对口腔-肠道菌群轴与各种疾病的关系进行深入研究。然而,由于种种局限,口腔-肠道菌群轴紊乱与各种疾病发生发展的因果关系不能确定。本文对口腔-肠道菌群轴的传播途径进行了总结,探讨了该轴与口腔疾病、炎症性肠病、结直肠癌、神经退行性疾病、代谢性疾病、心血管疾病及自身免疫性疾病等多种疾病的关联及相关作用机制,为未来口腔-肠道菌群轴紊乱与各种疾病关系的研究方向提供了参考,也为相关疾病诊断和治疗提供了新的思路。 微生物组在妇科恶性肿瘤发生发展中的作用及机制 杨美琴,龚滢欣,汤雨琪,王薇 2026,53(10):5292-5301, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260346 CSTR: 32113.14.j.MC.260346 摘要: (1) HTML (2) PDF (781.85 K)( 1 ) Abstract: 女性生殖道及肠道微生物组失衡不仅与妇科恶性肿瘤密切相关,而且可能通过重塑局部微环境参与肿瘤发生发展。现有证据显示,宫颈癌、子宫内膜癌及卵巢癌均伴随特征性微生物群组成和功能改变,微生态失衡可通过诱导慢性炎症、促进免疫逃逸、调控代谢重编程及激素代谢异常等多种机制驱动肿瘤发生发展,并影响疾病进展及治疗反应。与此同时,微生物组在疾病早期筛查、风险评估、疗效预测及微生态干预治疗等方面展现出重要的临床转化潜力。然而,上生殖道及肿瘤组织属于低生物量样本,相关研究易受到污染和技术偏倚影响,因果关系及机制证据仍有待进一步验证。本文综述女性生殖道及肠道微生物组在妇科恶性肿瘤中的变化特征、作用机制及临床转化前景,并对未来研究方向进行展望,以期为妇科恶性肿瘤的精准防治提供新的理论依据和研究思路。 2026,53(10):5292-5301, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260346 CSTR: 32113.14.j.MC.260346 女性生殖道及肠道微生物组失衡不仅与妇科恶性肿瘤密切相关,而且可能通过重塑局部微环境参与肿瘤发生发展。现有证据显示,宫颈癌、子宫内膜癌及卵巢癌均伴随特征性微生物群组成和功能改变,微生态失衡可通过诱导慢性炎症、促进免疫逃逸、调控代谢重编程及激素代谢异常等多种机制驱动肿瘤发生发展,并影响疾病进展及治疗反应。与此同时,微生物组在疾病早期筛查、风险评估、疗效预测及微生态干预治疗等方面展现出重要的临床转化潜力。然而,上生殖道及肿瘤组织属于低生物量样本,相关研究易受到污染和技术偏倚影响,因果关系及机制证据仍有待进一步验证。本文综述女性生殖道及肠道微生物组在妇科恶性肿瘤中的变化特征、作用机制及临床转化前景,并对未来研究方向进行展望,以期为妇科恶性肿瘤的精准防治提供新的理论依据和研究思路。 人体定量微生物组学:从相对丰度到组成-负荷二维范式的跨越 蔡斌,叶天文,付锦霞,胡懿娟,王春香 2026,53(10):5302-5321, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260352 CSTR: 32113.14.j.MC.260352 摘要: (1) HTML (2) PDF (1.51 M)( 1 ) Abstract: 高通量测序技术推动人体微生物组研究进入大数据时代,揭示了微生物组与宿主健康的密切关联。然而,传统的扩增子和宏基因组测序是一类相对定量微生物组(relative microbiome profiling, RMP)检测方法,仅能获得微生物的相对丰度数据,无法准确揭示微生物群落总负荷的真实变化。更为关键的是,这类数据本质上属于组成性数据体系(compositional data),其封闭性约束会系统性地引入伪相关与解释偏差,而非简单的技术误差。人们在结合表型数据寻找疾病与微生物关联分析时,RMP结果常推导出大量伪相关性结论,严重制约机制解析和临床转化。为了解决这一根本性问题,定量微生物组(quantitative microbiome profiling, QMP)应运而生。本文系统梳理了流式细胞术、拉曼光谱、qPCR、数字PCR (digital polymerase chain reaction, dPCR)、内标定量法(spike-in)、培养组学定量法及机器学习预测等主流绝对定量技术的原理、优势与局限,并从统一方法学视角对不同技术的测量层级与校正范围进行了系统归纳,总结其在肠型重定义、消化系统疾病、口腔-肠道菌群易位、神经系统疾病及代谢性疾病中的关键作用。进一步从机制层面强调,微生物负荷(microbial load)作为独立维度,是理解微生物组变化的基础之一。最后,本文讨论了宏转录组绝对定量、临床转化及多组学整合等前沿方向,并展望了标准化、跨平台一致性及活菌区分等关键挑战。总体而言,QMP不仅是技术改进,更代表将来微生物组研究从单一组成维度拓展为组成-负荷二维体系的方法学范式重构。 1 2 蔡斌,叶天文,付锦霞,胡懿娟,王春香 2026,53(10):5302-5321, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260352 CSTR: 32113.14.j.MC.260352 高通量测序技术推动人体微生物组研究进入大数据时代,揭示了微生物组与宿主健康的密切关联。然而,传统的扩增子和宏基因组测序是一类相对定量微生物组(relative microbiome profiling, RMP)检测方法,仅能获得微生物的相对丰度数据,无法准确揭示微生物群落总负荷的真实变化。更为关键的是,这类数据本质上属于组成性数据体系(compositional data),其封闭性约束会系统性地引入伪相关与解释偏差,而非简单的技术误差。人们在结合表型数据寻找疾病与微生物关联分析时,RMP结果常推导出大量伪相关性结论,严重制约机制解析和临床转化。为了解决这一根本性问题,定量微生物组(quantitative microbiome profiling, QMP)应运而生。本文系统梳理了流式细胞术、拉曼光谱、qPCR、数字PCR (digital polymerase chain reaction, dPCR)、内标定量法(spike-in)、培养组学定量法及机器学习预测等主流绝对定量技术的原理、优势与局限,并从统一方法学视角对不同技术的测量层级与校正范围进行了系统归纳,总结其在肠型重定义、消化系统疾病、口腔-肠道菌群易位、神经系统疾病及代谢性疾病中的关键作用。进一步从机制层面强调,微生物负荷(microbial load)作为独立维度,是理解微生物组变化的基础之一。最后,本文讨论了宏转录组绝对定量、临床转化及多组学整合等前沿方向,并展望了标准化、跨平台一致性及活菌区分等关键挑战。总体而言,QMP不仅是技术改进,更代表将来微生物组研究从单一组成维度拓展为组成-负荷二维体系的方法学范式重构。 基于信息增益分子生态网络构建解析凝结魏茨曼氏菌靶向核心菌群的跨队列精准干预 叶云飞,牛雨婷,蒋怡茹,赵丽娜,李璇,吴影,古绍彬 2026,53(10):5322-5346, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260360 CSTR: 32113.14.j.MC.260360 摘要: (1) HTML (2) PDF (6.27 M)( 1 ) Abstract: 背景 肠道微生态失衡与多种慢性疾病相关,而凝结魏茨曼氏菌( Weizmannia coagulans ) BC99作为重要的微生态调节因子,其功能食品的开发与应用受到广泛关注。 目的 阐明其作为功能性益生菌在不同疾病人群中的微生态调节特征。 方法 整合4个接受该菌干预的临床队列16S rRNA基因数据,基于信息增益分子生态网络(information gain-based microbial ecological networks, IG-MENs)方法,从肠道微生态网络层面解析菌株BC99的调控效应。 结果 发现4个队列均稳定识别出两类网络社区,分别定义为桥接型社区和核心型社区。但干预效应存在差异,表现为:增强幽门螺杆菌( Helicobacter pylori )感染队列、便秘队列和鼻炎队列的网络鲁棒性;扩大酒精性损伤队列的网络规模;并且重塑4个队列核心菌群的群落结构。同时识别出以毛螺菌科( Lachnospiraceae )、布劳特氏菌属( Blautia )、拟杆菌属( Bacteroides )、链球菌属( Streptococcus )为主的跨队列核心微生物,提示这些微生物可能是跨队列稳定存在的疾病相关的关键菌群。 结论 菌株BC99可通过调控核心菌群及其网络结构,实现对肠道微生态的整体优化。为益生菌在功能性食品中的开发提供微生态网络层面的理论依据,同时为基于核心菌群调控的发酵产品设计与精准营养干预策略提供参考。 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 叶云飞,牛雨婷,蒋怡茹,赵丽娜,李璇,吴影,古绍彬 2026,53(10):5322-5346, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260360 CSTR: 32113.14.j.MC.260360 背景 肠道微生态失衡与多种慢性疾病相关,而凝结魏茨曼氏菌( Weizmannia coagulans ) BC99作为重要的微生态调节因子,其功能食品的开发与应用受到广泛关注。 目的 阐明其作为功能性益生菌在不同疾病人群中的微生态调节特征。 方法 整合4个接受该菌干预的临床队列16S rRNA基因数据,基于信息增益分子生态网络(information gain-based microbial ecological networks, IG-MENs)方法,从肠道微生态网络层面解析菌株BC99的调控效应。 结果 发现4个队列均稳定识别出两类网络社区,分别定义为桥接型社区和核心型社区。但干预效应存在差异,表现为:增强幽门螺杆菌( Helicobacter pylori )感染队列、便秘队列和鼻炎队列的网络鲁棒性;扩大酒精性损伤队列的网络规模;并且重塑4个队列核心菌群的群落结构。同时识别出以毛螺菌科( Lachnospiraceae )、布劳特氏菌属( Blautia )、拟杆菌属( Bacteroides )、链球菌属( Streptococcus )为主的跨队列核心微生物,提示这些微生物可能是跨队列稳定存在的疾病相关的关键菌群。 结论 菌株BC99可通过调控核心菌群及其网络结构,实现对肠道微生态的整体优化。为益生菌在功能性食品中的开发提供微生态网络层面的理论依据,同时为基于核心菌群调控的发酵产品设计与精准营养干预策略提供参考。 肠道微生物调节衰老的作用机制及其潜在应用 皇甫子俊,伍强,王晓玲,罗非君,沈珺珺 2026,53(10):5347-5362, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251318 CSTR: 32113.14.j.MC.251318 摘要: (1) HTML (2) PDF (1.46 M)( 1 ) Abstract: 全球老龄化问题加剧,已成为重大公共卫生挑战。衰老涉及机体功能逐步衰退,也是多种慢性疾病发生的重要基础。肠道微生物及其代谢物在维持肠道稳态以及调节宿主代谢、免疫和神经内分泌功能等方面发挥重要作用,并与机体衰老密切相关。然而,现有研究多集中于个别菌种或单一代谢物,其在衰老进程中发挥的整体作用及相关调控机制尚缺乏系统研究。本文围绕肠道微生物及其代谢产物参与衰老双向调控作用的研究进行综述,归纳代谢物靶向干预、肠道菌群重塑等策略在抗衰老研究中的应用现状,分析其潜在优势与局限性。同时,结合衰老动态调控中的异质性与复杂性,对人工智能辅助分析及类器官、人源化模型等研究手段的应用前景进行展望,以期为肠道菌群微生物介导的衰老机制研究及干预策略的开发提供参考。 1 2 皇甫子俊,伍强,王晓玲,罗非君,沈珺珺 2026,53(10):5347-5362, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251318 CSTR: 32113.14.j.MC.251318 全球老龄化问题加剧,已成为重大公共卫生挑战。衰老涉及机体功能逐步衰退,也是多种慢性疾病发生的重要基础。肠道微生物及其代谢物在维持肠道稳态以及调节宿主代谢、免疫和神经内分泌功能等方面发挥重要作用,并与机体衰老密切相关。然而,现有研究多集中于个别菌种或单一代谢物,其在衰老进程中发挥的整体作用及相关调控机制尚缺乏系统研究。本文围绕肠道微生物及其代谢产物参与衰老双向调控作用的研究进行综述,归纳代谢物靶向干预、肠道菌群重塑等策略在抗衰老研究中的应用现状,分析其潜在优势与局限性。同时,结合衰老动态调控中的异质性与复杂性,对人工智能辅助分析及类器官、人源化模型等研究手段的应用前景进行展望,以期为肠道菌群微生物介导的衰老机制研究及干预策略的开发提供参考。 食用菌多糖通过肠道菌群调控脂肪代谢机制研究进展 弥春霞,范佳欣,张博妍,陈媛媛,金瑞娇,马传贵,赵爽 2026,53(10):5363-5378, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251363 CSTR: 32113.14.j.MC.251363 摘要: (1) HTML (3) PDF (1.13 M)( 1 ) Abstract: 肥胖是引发多种代谢性疾病的重要因素,然而现有治疗方法存在副作用明显、患者难以长期坚持等问题,因此,寻找安全有效的天然调控物质成为新的研究方向。食用菌多糖作为从食用菌中提取的天然成分,具有调节脂肪代谢的潜在作用,并且肠道菌群在这一过程中起到关键的介导作用。本文系统梳理了食用菌多糖的结构特征对肠道菌群多样性的调控规律,深入分析了其通过肠道菌群调控脂肪代谢的核心途径:一是选择性调节肠道内有益菌和有害菌的比例,优化肠道菌群结构;二是影响肠道菌群产生的代谢产物,促进有益代谢物生成并调节相关代谢过程;三是抑制肠道炎症反应,减少炎症对脂肪代谢的不良影响。本研究明确了食用菌多糖、肠道菌群与脂肪代谢三者之间的关联,为理解天然多糖调控代谢的作用机制提供了清晰框架,也为开发基于天然成分的肥胖及相关代谢疾病干预方案提供了科学参考。 1 弥春霞,范佳欣,张博妍,陈媛媛,金瑞娇,马传贵,赵爽 2026,53(10):5363-5378, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251363 CSTR: 32113.14.j.MC.251363 肥胖是引发多种代谢性疾病的重要因素,然而现有治疗方法存在副作用明显、患者难以长期坚持等问题,因此,寻找安全有效的天然调控物质成为新的研究方向。食用菌多糖作为从食用菌中提取的天然成分,具有调节脂肪代谢的潜在作用,并且肠道菌群在这一过程中起到关键的介导作用。本文系统梳理了食用菌多糖的结构特征对肠道菌群多样性的调控规律,深入分析了其通过肠道菌群调控脂肪代谢的核心途径:一是选择性调节肠道内有益菌和有害菌的比例,优化肠道菌群结构;二是影响肠道菌群产生的代谢产物,促进有益代谢物生成并调节相关代谢过程;三是抑制肠道炎症反应,减少炎症对脂肪代谢的不良影响。本研究明确了食用菌多糖、肠道菌群与脂肪代谢三者之间的关联,为理解天然多糖调控代谢的作用机制提供了清晰框架,也为开发基于天然成分的肥胖及相关代谢疾病干预方案提供了科学参考。 斯皮氏芽孢杆菌产 β-1,3-1,4- 葡聚糖酶的发酵条件优化与酶学性质 魏家永,谭琳慧,李延啸,王楠楠,江正强 2026,53(10):5379-5392, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260001 CSTR: 32113.14.j.MC.260001 摘要: (3) HTML (3) PDF (1.87 M)( 2 ) Abstract: 背景 天然芽孢杆菌产β-1,3-1,4-葡聚糖酶水平整体偏低,难以大规模应用。 目的 从土壤中筛选高产β-1,3-1,4-葡聚糖酶的菌株,研究其相关酶学性质,为开发新型β-1,3-1,4-葡聚糖酶及其在食品等工业中的应用提供技术支撑。 方法 通过形态学观察和16S rRNA基因序列分析进行菌种鉴定。采用单因素试验对菌株的液体发酵产酶条件进行优化,经硫酸铵分级沉淀和Q-Sepharose Fast Flow阴离子交换层析纯化后,测定其酶学性质。 结果 从土壤中分离获得1株高产β-1,3-1,4-葡聚糖酶的细菌,鉴定为斯皮氏芽孢杆菌( Bacillus spizizenii ),命名为HWD28。以6.0%大麦粉为碳源,4.0%干酪素为氮源,0.5%吐温-20为表面活性剂,在初始pH 8.0和40 ℃条件下发酵4 d,发酵液酶活力高达4 048 U/mL,高于目前已报道细菌产β-1,3-1,4-葡聚糖酶活力。两步纯化获得分子量约为28 kDa的电泳级纯酶BsGluA。该酶最适反应条件为pH 7.0、50 ℃,并在pH 5.0-10.0范围内保持良好的稳定性。60 ℃处理30 min后仍能保持80%以上酶活。BsGluA对β-1,3-1,4-葡聚糖底物表现出严格专一性,仅能高效水解大麦β-葡聚糖、燕麦β-葡聚糖和地衣多糖。 结论 斯皮氏芽孢杆菌HWD28产β-1,3-1,4-葡聚糖酶产量高且酶学性质好,在食品和饲料工业中具有良好的应用前景。 1 2 3 4 5 6 7 魏家永,谭琳慧,李延啸,王楠楠,江正强 2026,53(10):5379-5392, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260001 CSTR: 32113.14.j.MC.260001 背景 天然芽孢杆菌产β-1,3-1,4-葡聚糖酶水平整体偏低,难以大规模应用。 目的 从土壤中筛选高产β-1,3-1,4-葡聚糖酶的菌株,研究其相关酶学性质,为开发新型β-1,3-1,4-葡聚糖酶及其在食品等工业中的应用提供技术支撑。 方法 通过形态学观察和16S rRNA基因序列分析进行菌种鉴定。采用单因素试验对菌株的液体发酵产酶条件进行优化,经硫酸铵分级沉淀和Q-Sepharose Fast Flow阴离子交换层析纯化后,测定其酶学性质。 结果 从土壤中分离获得1株高产β-1,3-1,4-葡聚糖酶的细菌,鉴定为斯皮氏芽孢杆菌( Bacillus spizizenii ),命名为HWD28。以6.0%大麦粉为碳源,4.0%干酪素为氮源,0.5%吐温-20为表面活性剂,在初始pH 8.0和40 ℃条件下发酵4 d,发酵液酶活力高达4 048 U/mL,高于目前已报道细菌产β-1,3-1,4-葡聚糖酶活力。两步纯化获得分子量约为28 kDa的电泳级纯酶BsGluA。该酶最适反应条件为pH 7.0、50 ℃,并在pH 5.0-10.0范围内保持良好的稳定性。60 ℃处理30 min后仍能保持80%以上酶活。BsGluA对β-1,3-1,4-葡聚糖底物表现出严格专一性,仅能高效水解大麦β-葡聚糖、燕麦β-葡聚糖和地衣多糖。 结论 斯皮氏芽孢杆菌HWD28产β-1,3-1,4-葡聚糖酶产量高且酶学性质好,在食品和饲料工业中具有良好的应用前景。 胶原蛋白酶产生菌的筛选及酶的分离纯化 李文钊,冯波,冯仕林,罗佳,陈志龙 2026,53(10):5393-5408, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251370 CSTR: 32113.14.j.MC.251370 摘要: (1) HTML (3) PDF (1.81 M)( 4 ) Abstract: 背景 Ⅱ型胶原蛋白在关节修复中发挥重要作用,利用胶原蛋白酶将其酶解为胶原三肽可以大幅提高吸收利用率。然而,目前已知的产胶原蛋白酶菌株主要来源于致病性弧菌和梭菌,这些菌株虽能降解胶原蛋白,但普遍存在毒力基因、酶产量较低的问题,不仅难以大规模生产,还存在安全隐患。贝莱斯芽孢杆菌( Bacillus velezensis )作为一种公认安全、非致病的菌种,具备包括胶原蛋白酶在内的强大酶系统。近期研究发现,贝莱斯芽孢杆菌LZ676能够高效水解牛皮胶原蛋白。因此,筛选兼具高效胶原降解能力与安全无毒特性的菌株,是实现胶原蛋白工业酶解应用的重要基础。 目的 从海鲜市场附近土壤中分离高产胶原蛋白酶的益生菌菌株,通过优化该菌株产酶的最适培养条件提高产量,摸索最佳纯化方法获得高活性、高得率的胶原蛋白酶,并进一步研究该酶的最适酶解条件。 方法 通过明胶液化实验对菌群初筛,并利用16S rRNA、 gyrA 和 gyrB 基因测序鉴定菌种的类型,探索候选菌株的发酵条件、纯化条件和酶解条件。 结果 CN24055候选菌株经鉴定为贝莱斯芽孢杆菌,通过优化其发酵条件,结果表明该菌株的最适培养成分为牛肉膏作为氮源和蔗糖作为碳源的组合,在接种比例为4%、pH 7.5、29 ℃的条件下发酵培养60 h时酶活最高,达到(442±5.5) U/mL。经60%的硫酸铵沉淀后,结合MMC和MMA离子柱纯化得到45 kDa左右的胶原蛋白酶,其比酶活为(1 565±305.9) U/mg,得率为10.1%。该酶对鲨鱼软骨来源的胶原蛋白酶的最佳酶解反应条件为pH 8.0和45 ℃。酶解产物中相对分子质量小于500 Da的多肽比例为42.96%,其中三肽占比为10.11%。 结论 本研究分离鉴定了1株高产胶原蛋白酶的益生菌菌株,并初步优化发酵培养条件、纯化条件以及酶解条件,为胶原蛋白酶的开发提供了重要的理论依据。 1 2 3 4 5 6 7 李文钊,冯波,冯仕林,罗佳,陈志龙 2026,53(10):5393-5408, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251370 CSTR: 32113.14.j.MC.251370 背景 Ⅱ型胶原蛋白在关节修复中发挥重要作用,利用胶原蛋白酶将其酶解为胶原三肽可以大幅提高吸收利用率。然而,目前已知的产胶原蛋白酶菌株主要来源于致病性弧菌和梭菌,这些菌株虽能降解胶原蛋白,但普遍存在毒力基因、酶产量较低的问题,不仅难以大规模生产,还存在安全隐患。贝莱斯芽孢杆菌( Bacillus velezensis )作为一种公认安全、非致病的菌种,具备包括胶原蛋白酶在内的强大酶系统。近期研究发现,贝莱斯芽孢杆菌LZ676能够高效水解牛皮胶原蛋白。因此,筛选兼具高效胶原降解能力与安全无毒特性的菌株,是实现胶原蛋白工业酶解应用的重要基础。 目的 从海鲜市场附近土壤中分离高产胶原蛋白酶的益生菌菌株,通过优化该菌株产酶的最适培养条件提高产量,摸索最佳纯化方法获得高活性、高得率的胶原蛋白酶,并进一步研究该酶的最适酶解条件。 方法 通过明胶液化实验对菌群初筛,并利用16S rRNA、 gyrA 和 gyrB 基因测序鉴定菌种的类型,探索候选菌株的发酵条件、纯化条件和酶解条件。 结果 CN24055候选菌株经鉴定为贝莱斯芽孢杆菌,通过优化其发酵条件,结果表明该菌株的最适培养成分为牛肉膏作为氮源和蔗糖作为碳源的组合,在接种比例为4%、pH 7.5、29 ℃的条件下发酵培养60 h时酶活最高,达到(442±5.5) U/mL。经60%的硫酸铵沉淀后,结合MMC和MMA离子柱纯化得到45 kDa左右的胶原蛋白酶,其比酶活为(1 565±305.9) U/mg,得率为10.1%。该酶对鲨鱼软骨来源的胶原蛋白酶的最佳酶解反应条件为pH 8.0和45 ℃。酶解产物中相对分子质量小于500 Da的多肽比例为42.96%,其中三肽占比为10.11%。 结论 本研究分离鉴定了1株高产胶原蛋白酶的益生菌菌株,并初步优化发酵培养条件、纯化条件以及酶解条件,为胶原蛋白酶的开发提供了重要的理论依据。 五大连池火山岩地衣结皮微生物群落对外加铁硫的响应 左成云,戚俊龙,贺双俊,张爽,晏磊 2026,53(10):5409-5430, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251342 CSTR: 32113.14.j.MC.251342 摘要: (1) HTML (3) PDF (3.63 M)( 1 ) Abstract: 背景 五大连池火山熔岩台地富含铁硫矿物,直接覆盖其上的地衣结皮微生物是驱动铁硫循环的关键,但微生物如何在极端环境中进行响应,尚缺乏深入研究。 目的 探究五大连池火山岩地衣结皮微生物(结皮微生物)对外加铁硫的响应,为火山环境微生物对铁硫循环的研究提供理论依据。 方法 本研究对火山岩地衣结皮样品分别用含硫酸亚铁或硫代硫酸钠的基础无机盐溶液喷施培养140 d,采集培养前后地衣结皮样品,利用宏基因组测序技术分析结皮微生物组成变化及铁、硫代谢基因的变化。 结果 铁处理显著提高泛菌属( Pantoea )、马赛菌属( Massilia )、离蠕孢属( Bipolaris )、肠杆菌属( Enterobacter )的丰度,硫处理显著提高 Pantoea 、 Enterobacter 、小浴氏菌属( Kosakonia )、克洛诺斯杆菌属( Cronobacter )、假单胞菌属( Pseudomonas )的丰度。典范对应分析(canonical correspondence analysis, CCA)得出铁处理下微生物变化受含水量、pH和Fe(Ⅱ)影响,硫处理组下微生物受含水量和pH影响。KEGG富集分析表明,铁或硫处理后结皮微生物的ABC转运蛋白、铁载体非核糖体肽的生物合成、卟啉与叶绿素代谢等铁代谢相关通路和硫代谢、硫中继系统、硫胺素代谢等硫代谢相关通路显著富集;铁代谢相关基因 bfr 、 dps 、 exbB 、 exbD 、 feoA 、 feoB 和硫代谢相关基因 cysH 、 cysI 、 cysJ 表达量显著上升。 结论 结皮微生物多样性受Fe(Ⅱ)、pH和含水量驱动,通过调节铁和硫代谢相关基因的表达参与地球铁硫循环。该结果为火山岩石表面地衣结皮微生物介导的铁硫代谢研究奠定基础。 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 左成云,戚俊龙,贺双俊,张爽,晏磊 2026,53(10):5409-5430, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251342 CSTR: 32113.14.j.MC.251342 背景 五大连池火山熔岩台地富含铁硫矿物,直接覆盖其上的地衣结皮微生物是驱动铁硫循环的关键,但微生物如何在极端环境中进行响应,尚缺乏深入研究。 目的 探究五大连池火山岩地衣结皮微生物(结皮微生物)对外加铁硫的响应,为火山环境微生物对铁硫循环的研究提供理论依据。 方法 本研究对火山岩地衣结皮样品分别用含硫酸亚铁或硫代硫酸钠的基础无机盐溶液喷施培养140 d,采集培养前后地衣结皮样品,利用宏基因组测序技术分析结皮微生物组成变化及铁、硫代谢基因的变化。 结果 铁处理显著提高泛菌属( Pantoea )、马赛菌属( Massilia )、离蠕孢属( Bipolaris )、肠杆菌属( Enterobacter )的丰度,硫处理显著提高 Pantoea 、 Enterobacter 、小浴氏菌属( Kosakonia )、克洛诺斯杆菌属( Cronobacter )、假单胞菌属( Pseudomonas )的丰度。典范对应分析(canonical correspondence analysis, CCA)得出铁处理下微生物变化受含水量、pH和Fe(Ⅱ)影响,硫处理组下微生物受含水量和pH影响。KEGG富集分析表明,铁或硫处理后结皮微生物的ABC转运蛋白、铁载体非核糖体肽的生物合成、卟啉与叶绿素代谢等铁代谢相关通路和硫代谢、硫中继系统、硫胺素代谢等硫代谢相关通路显著富集;铁代谢相关基因 bfr 、 dps 、 exbB 、 exbD 、 feoA 、 feoB 和硫代谢相关基因 cysH 、 cysI 、 cysJ 表达量显著上升。 结论 结皮微生物多样性受Fe(Ⅱ)、pH和含水量驱动,通过调节铁和硫代谢相关基因的表达参与地球铁硫循环。该结果为火山岩石表面地衣结皮微生物介导的铁硫代谢研究奠定基础。 一株聚己内酯降解耐盐细菌 Bacillus sp. 的分离与产酶条件优化 邹世杰,邓常宇,王玉美,李文超,张琳,章圣龙,申贵男,王伟东 2026,53(10):5431-5446, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251335 CSTR: 32113.14.j.MC.251335 摘要: (1) HTML (3) PDF (2.48 M)( 3 ) Abstract: 背景 秸秆中木质纤维素抗生物降解屏障主要源于木质素-碳水化合物复合物(lignin-carbohydrate plexes, LCCs)中的酯键,东北寒区全年平均温度低的气候特点与部分地区的盐碱土壤环境均显著抑制了微生物活性,导致秸秆降解困难。 目的 从东北寒地盐碱土中分离耐盐碱产酯酶菌,为其作为核心功能菌株用于构建高效降解木质纤维素的合成菌群提供种质资源。 方法 取秸秆还田盐碱土壤样品进行富集,以聚己内酯(polycaprolactone, PCL)为唯一碳源,采用稀释涂布法分离纯培养菌株,通过单因素试验及响应面试验对菌株产酶条件进行优化。 结果 筛选到1株耐10% NaCl盐浓度、在15-45 ℃均可产酯酶的细菌,将其编号为T2。经16S rRNA基因测序分析确定其为芽孢杆菌属( Bacillus )。在初始pH值7.0、装液量40 mL/100 mL、接种量7%、30 ℃条件下,培养36 h酯酶酶活最高为3.35 U/mL。经产酶条件优化后,酯酶酶活提升至6.85 U/mL。菌株在最佳产酶培养条件下培养7 d对PCL、脱碱木质素、水稻秸秆的降解率分别为0.28%、7.42%、15.20%。 结论 菌株T2是一株耐盐、在低温下具产酯酶能力的秸秆降解菌,可为寒区盐碱土壤条件下的秸秆高效降解提供微生物资源。 1 2 3 4 5 邹世杰,邓常宇,王玉美,李文超,张琳,章圣龙,申贵男,王伟东 2026,53(10):5431-5446, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251335 CSTR: 32113.14.j.MC.251335 背景 秸秆中木质纤维素抗生物降解屏障主要源于木质素-碳水化合物复合物(lignin-carbohydrate plexes, LCCs)中的酯键,东北寒区全年平均温度低的气候特点与部分地区的盐碱土壤环境均显著抑制了微生物活性,导致秸秆降解困难。 目的 从东北寒地盐碱土中分离耐盐碱产酯酶菌,为其作为核心功能菌株用于构建高效降解木质纤维素的合成菌群提供种质资源。 方法 取秸秆还田盐碱土壤样品进行富集,以聚己内酯(polycaprolactone, PCL)为唯一碳源,采用稀释涂布法分离纯培养菌株,通过单因素试验及响应面试验对菌株产酶条件进行优化。 结果 筛选到1株耐10% NaCl盐浓度、在15-45 ℃均可产酯酶的细菌,将其编号为T2。经16S rRNA基因测序分析确定其为芽孢杆菌属( Bacillus )。在初始pH值7.0、装液量40 mL/100 mL、接种量7%、30 ℃条件下,培养36 h酯酶酶活最高为3.35 U/mL。经产酶条件优化后,酯酶酶活提升至6.85 U/mL。菌株在最佳产酶培养条件下培养7 d对PCL、脱碱木质素、水稻秸秆的降解率分别为0.28%、7.42%、15.20%。 结论 菌株T2是一株耐盐、在低温下具产酯酶能力的秸秆降解菌,可为寒区盐碱土壤条件下的秸秆高效降解提供微生物资源。 浴场海水中耐药致病性大肠杆菌人体健康风险评估 苏洁,李婷婷,郭戈,石婷婷,明红霞,樊景凤 2026,53(10):5447-5459, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260644 CSTR: 32113.14.j.MC.260644 摘要: (1) HTML (3) PDF (1.92 M)( 2 ) Abstract: 背景 以大连星海浴场为代表区域,以粪便污染重要指示微生物——大肠杆菌( Escherichia coli )为研究对象,开展海水浴场中耐药致病性大肠杆菌时空分布特征及其人体健康风险研究。 目的 评估海水浴场中耐药致病性大肠杆菌的人体健康风险。 方法 采用滤膜法初步筛选分离浴场海水中大肠杆菌,经生理生化鉴定后,利用纸片扩散法进行药敏试验,PCR法检测毒力基因,结合健康暴露风险评估公式与β-泊松分布模型,分别开展耐药致病性大肠杆菌的暴露风险评价与患病概率分析。 结果 四季采集的大连星海浴场海水中初筛得到20 242株疑似大肠杆菌菌株,经鉴定获得5 979株大肠杆菌,其丰度呈夏季>秋季>春季>冬季的季节特征,7月份最高(1 870 CFU/L),2月份最低(21 CFU/L);空间上表现为入海雨洪排口>近岸>远岸>对照点;分离菌株耐药率高达100%,对β-内酰胺类和喹诺酮类抗生素具有较高的耐药性,耐药菌株时空分布与大肠杆菌丰度高度一致;83% (4 967株)的耐药菌株检测出毒力基因,其中 astA 检出率最高(39%); stx - 1 最低(29%);不同人群单次吞咽耐药致病性大肠杆菌的数量差异较小,全年摄入水平季节性波动显著,夏季为峰值,秋冬春季维持低位;成年男性、成年女性及儿童的患病概率分别为1.33×10 -6 、1.06×10 -6 、1.04×10 -6 ,均低于美国环境保护署(Environmental Protection Agency, EPA)规定的最高患病阈值(1.9%)。 结论 大连星海浴场海水中耐药致病性大肠杆菌对人体健康构成低风险,但夏季高丰度及高致病性毒力基因的高携带率提示需持续关注陆源输入与游泳高峰期水质管理。 1 2 3 4 5 苏洁,李婷婷,郭戈,石婷婷,明红霞,樊景凤 2026,53(10):5447-5459, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260644 CSTR: 32113.14.j.MC.260644 背景 以大连星海浴场为代表区域,以粪便污染重要指示微生物——大肠杆菌( Escherichia coli )为研究对象,开展海水浴场中耐药致病性大肠杆菌时空分布特征及其人体健康风险研究。 目的 评估海水浴场中耐药致病性大肠杆菌的人体健康风险。 方法 采用滤膜法初步筛选分离浴场海水中大肠杆菌,经生理生化鉴定后,利用纸片扩散法进行药敏试验,PCR法检测毒力基因,结合健康暴露风险评估公式与β-泊松分布模型,分别开展耐药致病性大肠杆菌的暴露风险评价与患病概率分析。 结果 四季采集的大连星海浴场海水中初筛得到20 242株疑似大肠杆菌菌株,经鉴定获得5 979株大肠杆菌,其丰度呈夏季>秋季>春季>冬季的季节特征,7月份最高(1 870 CFU/L),2月份最低(21 CFU/L);空间上表现为入海雨洪排口>近岸>远岸>对照点;分离菌株耐药率高达100%,对β-内酰胺类和喹诺酮类抗生素具有较高的耐药性,耐药菌株时空分布与大肠杆菌丰度高度一致;83% (4 967株)的耐药菌株检测出毒力基因,其中 astA 检出率最高(39%); stx - 1 最低(29%);不同人群单次吞咽耐药致病性大肠杆菌的数量差异较小,全年摄入水平季节性波动显著,夏季为峰值,秋冬春季维持低位;成年男性、成年女性及儿童的患病概率分别为1.33×10 -6 、1.06×10 -6 、1.04×10 -6 ,均低于美国环境保护署(Environmental Protection Agency, EPA)规定的最高患病阈值(1.9%)。 结论 大连星海浴场海水中耐药致病性大肠杆菌对人体健康构成低风险,但夏季高丰度及高致病性毒力基因的高携带率提示需持续关注陆源输入与游泳高峰期水质管理。 铜绿微囊藻次级代谢产物对氨氧化细菌氨氧化活性的抑制效应 祝航,李金兰,冯倩倩,梅洪,程龙,程凯 2026,53(10):5460-5478, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251329 CSTR: 32113.14.j.MC.251329 摘要: (1) HTML (3) PDF (3.05 M)( 2 ) Abstract: 背景 铜绿微囊藻( Microcystis aeruginosa )作为富营养化水体的优势物种,其通过分泌代谢产物抑制自养氨氧化细菌(ammonia-oxidizing bacteria, AOB)的机制尚不明确。 目的 解释铜绿微囊藻的生态优势地位,并发掘其实际应用价值。 方法 以1株高产毒株铜绿微囊藻FACHB-905及2种AOB菌株[欧洲亚硝化单胞菌( Nitrosomonas eutropha ) CZ-4和 Nitrosomonas nitrosa SN-6]为对象,采用透析试验测试了铜绿微囊藻FACHB-905对AOB氨氧化活性的抑制作用,结合GC-MS分析、16S rRNA基因高通量测序等方法,探索了藻源性小分子物质对AOB氨氧化活性的抑制效应,并在河水与市政污水中验证了其中3种小分子物质对硝化作用的抑制效应。 结果 铜绿微囊藻FACHB-905可以分泌分子量<1 000 Da的藻源性小分子物质来抑制AOB的氨氧化活性,抑制率为60.30%-62.36%;铜绿微囊藻胞外分泌物中共鉴定出15种分子量均小于200 Da的小分子化合物,其中N-乙基哌嗪、5-甲基异恶唑、4-甲基-1-哌嗪乙胺对 Nitrosomonas eutropha CZ-4氨氧化活性的半数抑制浓度( IC 50 )分别为19.05、25.37、34.85 mg/L;N-乙基哌嗪、5-甲基异恶唑、4-甲基-1-哌嗪乙胺均可显著抑制河水与活性污泥的硝化活性,并限制亚硝化单胞菌属( Nitrosomonas )与硝化螺菌属( Nitrospira )相对丰度的增加,但对其他细菌的影响较小。 结论 铜绿微囊藻所分泌的小分子物质可以在较低浓度下抑制AOB的氨氧化活性及河水和活性污泥中AOB的生物量积累,既从化感作用的角度解释了铜绿微囊藻在富营养化水体中的优势生态地位,也为新型硝化抑制剂的开发提供了线索。 1 2 3 4 5 6 7 8 祝航,李金兰,冯倩倩,梅洪,程龙,程凯 2026,53(10):5460-5478, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251329 CSTR: 32113.14.j.MC.251329 背景 铜绿微囊藻( Microcystis aeruginosa )作为富营养化水体的优势物种,其通过分泌代谢产物抑制自养氨氧化细菌(ammonia-oxidizing bacteria, AOB)的机制尚不明确。 目的 解释铜绿微囊藻的生态优势地位,并发掘其实际应用价值。 方法 以1株高产毒株铜绿微囊藻FACHB-905及2种AOB菌株[欧洲亚硝化单胞菌( Nitrosomonas eutropha ) CZ-4和 Nitrosomonas nitrosa SN-6]为对象,采用透析试验测试了铜绿微囊藻FACHB-905对AOB氨氧化活性的抑制作用,结合GC-MS分析、16S rRNA基因高通量测序等方法,探索了藻源性小分子物质对AOB氨氧化活性的抑制效应,并在河水与市政污水中验证了其中3种小分子物质对硝化作用的抑制效应。 结果 铜绿微囊藻FACHB-905可以分泌分子量<1 000 Da的藻源性小分子物质来抑制AOB的氨氧化活性,抑制率为60.30%-62.36%;铜绿微囊藻胞外分泌物中共鉴定出15种分子量均小于200 Da的小分子化合物,其中N-乙基哌嗪、5-甲基异恶唑、4-甲基-1-哌嗪乙胺对 Nitrosomonas eutropha CZ-4氨氧化活性的半数抑制浓度( IC 50 )分别为19.05、25.37、34.85 mg/L;N-乙基哌嗪、5-甲基异恶唑、4-甲基-1-哌嗪乙胺均可显著抑制河水与活性污泥的硝化活性,并限制亚硝化单胞菌属( Nitrosomonas )与硝化螺菌属( Nitrospira )相对丰度的增加,但对其他细菌的影响较小。 结论 铜绿微囊藻所分泌的小分子物质可以在较低浓度下抑制AOB的氨氧化活性及河水和活性污泥中AOB的生物量积累,既从化感作用的角度解释了铜绿微囊藻在富营养化水体中的优势生态地位,也为新型硝化抑制剂的开发提供了线索。 光照条件下外源碳添加对沙漠小球藻 GTD4C-2 胞内多糖代谢组学及理化性质的影响 王路,张凯月,陈敏,高剑峰,陈福龙 2026,53(10):5479-5490, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251339 CSTR: 32113.14.j.MC.251339 摘要: (1) HTML (2) PDF (1.45 M)( 2 ) Abstract: 背景 沙漠微藻长期适应干旱、强光照及昼夜温差等极端环境,其胞内多糖 (intracellular polysaccharides, IPs)因独特的抗逆代谢重编程而呈现区别于淡水与海洋微藻的结构特征及抗氧化活性,是功能性生物制品的潜在资源。已有研究表明,外源碳添加可通过重构中心碳代谢流定向调控微藻多糖的生物合成,但针对沙漠小球藻在光照耦合外源碳条件下的糖代谢响应规律及IPs理化特性尚缺乏系统解析。 目的 沙漠小球藻( Chlorella sp. GTD4C-2)在光照条件下添加外源碳(乙酸钠、葡萄糖)培养,研究其对数期靶向糖代谢差异变化和GTD4C-2胞内多糖(intracellular polysaccharides, IPs)理化性质以及抗氧化分析。 方法 以纯化后GTD4C-2为研究材料,以光自养条件下正常培养的GTD4C-2为对照(CK),测定对数生长期小球藻靶向糖代谢产物,采用偏最小二乘法判别分析(partial least squares-discriminant analysis, PLS-DA)筛选差异代谢物并进行KEGG代谢通路分析。采用4% (质量分数)氢氧化钠(NaOH)溶液进行提取IPs,评估其体外抗氧化活性。 结果 添加外源碳源使得GTD4C-2中11种单糖代谢通量产生差异化,其中蔗糖及D-半乳糖的代谢最为显著;差异代谢物主要富集于戊糖磷酸途径(pentose phosphate pathway, PPP)和半乳糖代谢通路。在自养培养条件下,IPs表现出显著的抗氧化特性:其1,1-二苯基-2-三硝基苯肼(1,1-diphenyl-2-picrylhydrazyl, DPPH)自由基清除率在0.2 mg/mL浓度下达(85.10±0.09)%;羟基自由基(·OH)清除率在0.2 mg/mL浓度下为(31.00±0.89)%。组分分析表明,其单糖组成中葡萄糖含量较低,均值为(0.213±0.096) mg/g。 结论 本研究揭示了外源碳添加通过调控沙漠小球藻GTD4C-2的糖代谢通路影响IPs组成与抗氧化活性的规律,为开发基于该藻株的功能性制品提供了理论依据,在能源生产(如生物燃料开发)、食品工业(营养强化剂)、制药领域(生物活性物质提取)及医疗保健(抗氧化剂应用)等方面具有潜在应用价值。 1 2 3 4 5 6 王路,张凯月,陈敏,高剑峰,陈福龙 2026,53(10):5479-5490, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251339 CSTR: 32113.14.j.MC.251339 背景 沙漠微藻长期适应干旱、强光照及昼夜温差等极端环境,其胞内多糖 (intracellular polysaccharides, IPs)因独特的抗逆代谢重编程而呈现区别于淡水与海洋微藻的结构特征及抗氧化活性,是功能性生物制品的潜在资源。已有研究表明,外源碳添加可通过重构中心碳代谢流定向调控微藻多糖的生物合成,但针对沙漠小球藻在光照耦合外源碳条件下的糖代谢响应规律及IPs理化特性尚缺乏系统解析。 目的 沙漠小球藻( Chlorella sp. GTD4C-2)在光照条件下添加外源碳(乙酸钠、葡萄糖)培养,研究其对数期靶向糖代谢差异变化和GTD4C-2胞内多糖(intracellular polysaccharides, IPs)理化性质以及抗氧化分析。 方法 以纯化后GTD4C-2为研究材料,以光自养条件下正常培养的GTD4C-2为对照(CK),测定对数生长期小球藻靶向糖代谢产物,采用偏最小二乘法判别分析(partial least squares-discriminant analysis, PLS-DA)筛选差异代谢物并进行KEGG代谢通路分析。采用4% (质量分数)氢氧化钠(NaOH)溶液进行提取IPs,评估其体外抗氧化活性。 结果 添加外源碳源使得GTD4C-2中11种单糖代谢通量产生差异化,其中蔗糖及D-半乳糖的代谢最为显著;差异代谢物主要富集于戊糖磷酸途径(pentose phosphate pathway, PPP)和半乳糖代谢通路。在自养培养条件下,IPs表现出显著的抗氧化特性:其1,1-二苯基-2-三硝基苯肼(1,1-diphenyl-2-picrylhydrazyl, DPPH)自由基清除率在0.2 mg/mL浓度下达(85.10±0.09)%;羟基自由基(·OH)清除率在0.2 mg/mL浓度下为(31.00±0.89)%。组分分析表明,其单糖组成中葡萄糖含量较低,均值为(0.213±0.096) mg/g。 结论 本研究揭示了外源碳添加通过调控沙漠小球藻GTD4C-2的糖代谢通路影响IPs组成与抗氧化活性的规律,为开发基于该藻株的功能性制品提供了理论依据,在能源生产(如生物燃料开发)、食品工业(营养强化剂)、制药领域(生物活性物质提取)及医疗保健(抗氧化剂应用)等方面具有潜在应用价值。 一种 GH3 家族硫代葡萄糖苷水解酶的鉴定及其催化特性 牛草原,李传浩,梁喜丽,吴元锋 2026,53(10):5491-5506, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260518 CSTR: 32113.14.j.MC.260518 摘要: (1) HTML (2) PDF (3.60 M)( 2 ) Abstract: 背景 萝卜硫苷(glucoraphanin, GRP)是十字花科植物中重要的硫代葡萄糖苷,其水解产物萝卜硫素(sulforaphane, SFN)具有显著的生物活性。然而,植物源黑芥子酶稳定性较差,限制了其应用,微生物来源硫苷水解酶的挖掘及其催化特性研究具有重要意义。 目的 筛选具有GRP转化能力的微生物资源,鉴定其关键硫代葡萄糖苷水解酶,并解析其催化特性。 方法 从十字花科植物相关环境中分离获得菌株,并通过HPLC筛选其对GRP的转化能力;结合全基因组测序与生物信息学分析挖掘候选功能酶基因,并利用RT-qPCR分析其表达响应特征;进一步通过异源表达获得重组酶,系统测定其酶学性质及动力学参数( K m , V max ),同时采用液相色谱-质谱联用技术(LC-MS/MS)解析不同反应体系中的产物组成。 结果 筛选获得1株具有GRP转化能力的菌株,其GRP降解率为39.62%,异硫氰酸酯生成率为19.80%。基因组分析鉴定4个GH3家族候选基因,其中 ctg-00044 在GRP诱导下显著上调至对照的1.65倍。重组酶以GRP为底物的 K m 为4.479 mmol/L, V max 为15.09 U/mg。产物分析表明在菌体发酵体系中主要生成萝卜硫素半胱氨酸(sulforaphane-cysteine, SFN-Cys),而在纯化酶催化体系中主要生成SFN。 结论 本研究鉴定了一种GH3家族硫代葡萄糖苷水解酶并发现其在不同反应体系中呈现差异化产物形成特征,提示微生物细胞环境在硫代葡萄糖苷代谢过程中发挥重要调控作用。 1 2 3 4 5 6 7
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牛草原,李传浩,梁喜丽,吴元锋 2026,53(10):5491-5506, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260518 CSTR: 32113.14.j.MC.260518 背景 萝卜硫苷(glucoraphanin, GRP)是十字花科植物中重要的硫代葡萄糖苷,其水解产物萝卜硫素(sulforaphane, SFN)具有显著的生物活性。然而,植物源黑芥子酶稳定性较差,限制了其应用,微生物来源硫苷水解酶的挖掘及其催化特性研究具有重要意义。 目的 筛选具有GRP转化能力的微生物资源,鉴定其关键硫代葡萄糖苷水解酶,并解析其催化特性。 方法 从十字花科植物相关环境中分离获得菌株,并通过HPLC筛选其对GRP的转化能力;结合全基因组测序与生物信息学分析挖掘候选功能酶基因,并利用RT-qPCR分析其表达响应特征;进一步通过异源表达获得重组酶,系统测定其酶学性质及动力学参数( K m , V max ),同时采用液相色谱-质谱联用技术(LC-MS/MS)解析不同反应体系中的产物组成。 结果 筛选获得1株具有GRP转化能力的菌株,其GRP降解率为39.62%,异硫氰酸酯生成率为19.80%。基因组分析鉴定4个GH3家族候选基因,其中 ctg-00044 在GRP诱导下显著上调至对照的1.65倍。重组酶以GRP为底物的 K m 为4.479 mmol/L, V max 为15.09 U/mg。产物分析表明在菌体发酵体系中主要生成萝卜硫素半胱氨酸(sulforaphane-cysteine, SFN-Cys),而在纯化酶催化体系中主要生成SFN。 结论 本研究鉴定了一种GH3家族硫代葡萄糖苷水解酶并发现其在不同反应体系中呈现差异化产物形成特征,提示微生物细胞环境在硫代葡萄糖苷代谢过程中发挥重要调控作用。 茶树菌根化苗内源茉莉酸对灰茶尺蠖幼虫取食的响应 连文旭,陈伟立,孙钦玉,叶涛,牛婷婷,林巧玲,张家侠 2026,53(10):5507-5521, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260002 CSTR: 32113.14.j.MC.260002 摘要: (1) HTML (3) PDF (1.89 M)( 1 ) Abstract: 背景 丛枝菌根真菌(arbuscular mycorrhizal fungi, AMF)与根系形成的共生体系能够提升植物对生物胁迫的抗性。然而,目前关于AMF调控茶树抵御害虫方面的研究鲜见报道。 目的 探究灰茶尺蠖( Ectropis grisescens )幼虫取食菌根化茶苗叶片后内源茉莉酸的响应机制。 方法 以‘皖茶4号’茶苗为材料,接种根内根孢囊霉( Rhizophagus intraradices )并进行灰茶尺蠖取食处理,测定茶苗生物量、幼虫体重变化、叶片内源茉莉酸与蛋白酶抑制剂含量、相关防御酶活性以及茉莉酸相关基因的表达水平。 结果 接种AMF显著降低茶苗根冠比和灰茶尺蠖幼虫体重增加比例,并显著调控茉莉酸信号通路相关基因的表达及提高脂氧合酶(lipoxygenase, LOX)和苯丙氨酸解氨酶(phenylalanine ammonia-lyase, PAL)活性。双因素方差分析显示,AMF对部分茉莉酸合成与信号转导相关基因( lox1 , lox2 , lox6 , lox7 , aos1 , aos2 , aoc , coi1a )具有显著主效应;皮尔逊相关分析揭示茉莉酸通路关键基因( aos2 , lox6 , lox7 , coi1a , jaz4 )的表达量与幼虫体重增加量呈显著正相关。 结论 AMF主要通过调控茉莉酸信号通路相关基因的表达,以及提升LOX和PAL等抗虫相关酶活性,增强茶树对灰茶尺蠖的抗性。本研究为阐释AMF诱导茶树抗虫的分子机制提供了基础理论依据。 1 2 3 4 5 6 连文旭,陈伟立,孙钦玉,叶涛,牛婷婷,林巧玲,张家侠 2026,53(10):5507-5521, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260002 CSTR: 32113.14.j.MC.260002 背景 丛枝菌根真菌(arbuscular mycorrhizal fungi, AMF)与根系形成的共生体系能够提升植物对生物胁迫的抗性。然而,目前关于AMF调控茶树抵御害虫方面的研究鲜见报道。 目的 探究灰茶尺蠖( Ectropis grisescens )幼虫取食菌根化茶苗叶片后内源茉莉酸的响应机制。 方法 以‘皖茶4号’茶苗为材料,接种根内根孢囊霉( Rhizophagus intraradices )并进行灰茶尺蠖取食处理,测定茶苗生物量、幼虫体重变化、叶片内源茉莉酸与蛋白酶抑制剂含量、相关防御酶活性以及茉莉酸相关基因的表达水平。 结果 接种AMF显著降低茶苗根冠比和灰茶尺蠖幼虫体重增加比例,并显著调控茉莉酸信号通路相关基因的表达及提高脂氧合酶(lipoxygenase, LOX)和苯丙氨酸解氨酶(phenylalanine ammonia-lyase, PAL)活性。双因素方差分析显示,AMF对部分茉莉酸合成与信号转导相关基因( lox1 , lox2 , lox6 , lox7 , aos1 , aos2 , aoc , coi1a )具有显著主效应;皮尔逊相关分析揭示茉莉酸通路关键基因( aos2 , lox6 , lox7 , coi1a , jaz4 )的表达量与幼虫体重增加量呈显著正相关。 结论 AMF主要通过调控茉莉酸信号通路相关基因的表达,以及提升LOX和PAL等抗虫相关酶活性,增强茶树对灰茶尺蠖的抗性。本研究为阐释AMF诱导茶树抗虫的分子机制提供了基础理论依据。 水稻白叶枯病菌受寄主诱导的蛋白质组学分析 张宇,李其利,唐利华,黄穗萍,张禹,玉延华,陈小林 2026,53(10):5522-5540, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251148 CSTR: 32113.14.j.MC.251148 摘要: (0) HTML (2) PDF (2.56 M)( 1 ) Abstract: 背景 水稻是为全世界约50%的人口提供主粮的极其重要的作物,而黄单胞菌水稻致病变种( Xanthomonas oryzae pv. oryzae , Xoo )引起的水稻白叶枯病(bacterial blight)是水稻上的重要病害之一。水稻白叶枯病菌主要通过分泌多种毒性因子以干扰寄主植物的正常代谢或抑制寄主植物的防卫反应,从而实现对寄主的系统侵染。 目的 探究野生型白叶枯病菌菌株N3-1中对水稻近等基因系CBB23 ( Xa23 )起关键作用的毒性因子,从蛋白水平揭示菌株N3-1的致病机制。 方法 利用4D-label-free定量蛋白质组学技术对菌株N3-1和PXO99 A 在XOM3液体基本培养基中受CBB23水稻愈伤组织诱导表达的蛋白质进行比较分析。以差异倍数>2倍(上调大于2倍或下调小于0.5倍),并以显著性检验 P <0.05为筛选标准,将得到的差异表达蛋白进行结构域、GO和KEGG富集分析。此外,对2个菌株双组分系统相关蛋白、效应蛋白、分泌系统相关蛋白和TonB蛋白进行比较分析。 结果 在诱导条件下,野生型菌株N3-1相比于模式菌株PXO99 A 上调表达蛋白57个,下调表达蛋白84个;菌株N3-1表达而PXO99 A 不表达,以及PXO99 A 表达但N3-1不表达的蛋白数均为23个。对菌株N3-1和PXO99 A 的差异表达蛋白进行结构域富集分析,结果显示差异表达蛋白富集在TonB-dependent receptor、TALE effector repeat、coiled stalk/head domain of trimeric autotransporter adhesin、dehydratase family等多个结构域。GO富集分析结果表明,差异表达蛋白主要富集在去磷酸化、致病过程、鞭毛组装、磷酸酶活性、水解酶活性、内肽酶活性等条目上。KEGG富集分析结果显示,差异表达蛋白在双组分信号通路上显著富集,包括CheA蛋白、CheW蛋白、MotA和PilG蛋白等,这些蛋白在病原菌信号传递、鞭毛运动以及致病性等细胞过程中均发挥重要作用。2个菌株的效应蛋白、分泌系统相关蛋白以及TonB蛋白上也存在明显表达差异。 结论 通过对水稻白叶枯病菌N3-1和PXO99 A 的蛋白组进行测定与比较分析,其结果为后续探究菌株N3-1克服水稻CBB23抗性的机制提供理论参考。 1 2 3 4 5 6 7 8 张宇,李其利,唐利华,黄穗萍,张禹,玉延华,陈小林 2026,53(10):5522-5540, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251148 CSTR: 32113.14.j.MC.251148 背景 水稻是为全世界约50%的人口提供主粮的极其重要的作物,而黄单胞菌水稻致病变种( Xanthomonas oryzae pv. oryzae , Xoo )引起的水稻白叶枯病(bacterial blight)是水稻上的重要病害之一。水稻白叶枯病菌主要通过分泌多种毒性因子以干扰寄主植物的正常代谢或抑制寄主植物的防卫反应,从而实现对寄主的系统侵染。 目的 探究野生型白叶枯病菌菌株N3-1中对水稻近等基因系CBB23 ( Xa23 )起关键作用的毒性因子,从蛋白水平揭示菌株N3-1的致病机制。 方法 利用4D-label-free定量蛋白质组学技术对菌株N3-1和PXO99 A 在XOM3液体基本培养基中受CBB23水稻愈伤组织诱导表达的蛋白质进行比较分析。以差异倍数>2倍(上调大于2倍或下调小于0.5倍),并以显著性检验 P <0.05为筛选标准,将得到的差异表达蛋白进行结构域、GO和KEGG富集分析。此外,对2个菌株双组分系统相关蛋白、效应蛋白、分泌系统相关蛋白和TonB蛋白进行比较分析。 结果 在诱导条件下,野生型菌株N3-1相比于模式菌株PXO99 A 上调表达蛋白57个,下调表达蛋白84个;菌株N3-1表达而PXO99 A 不表达,以及PXO99 A 表达但N3-1不表达的蛋白数均为23个。对菌株N3-1和PXO99 A 的差异表达蛋白进行结构域富集分析,结果显示差异表达蛋白富集在TonB-dependent receptor、TALE effector repeat、coiled stalk/head domain of trimeric autotransporter adhesin、dehydratase family等多个结构域。GO富集分析结果表明,差异表达蛋白主要富集在去磷酸化、致病过程、鞭毛组装、磷酸酶活性、水解酶活性、内肽酶活性等条目上。KEGG富集分析结果显示,差异表达蛋白在双组分信号通路上显著富集,包括CheA蛋白、CheW蛋白、MotA和PilG蛋白等,这些蛋白在病原菌信号传递、鞭毛运动以及致病性等细胞过程中均发挥重要作用。2个菌株的效应蛋白、分泌系统相关蛋白以及TonB蛋白上也存在明显表达差异。 结论 通过对水稻白叶枯病菌N3-1和PXO99 A 的蛋白组进行测定与比较分析,其结果为后续探究菌株N3-1克服水稻CBB23抗性的机制提供理论参考。 绿色荧光蛋白标记蒙氏假单胞菌水稻秸秆降解效能及定殖时空分布 赫晓彤,孙百宁,张爽,董悦,乔晟,晏磊 2026,53(10):5541-5555, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251331 CSTR: 32113.14.j.MC.251331 摘要: (1) HTML (3) PDF (2.59 M)( 1 ) Abstract: 背景 蒙氏假单胞菌( Pseudomonas mandelii ) NDSD-Z1是一株具有水稻秸秆降解潜力的功能菌株,但其对水稻秸秆的降解特性及降解过程中的表面定殖规律尚未得到系统阐明,制约了对其降解机制的深入解析。 目的 阐明绿色荧光蛋白(green fluorescent protein, GFP)标记菌株的生物学特性、水稻秸秆的降解效能及表面定殖时空分布规律。 方法 以质粒pUC57- sfGFP 为模板克隆 sfGFP 基因,采用无缝克隆技术构建重组质粒pBBR- sfGFP ,利用电击转化法将重组子导入菌株NDSD-Z1后,通过测定标记菌株的生长特性、遗传稳定性、木质纤维素酶活性、秸秆降解能力及其在水稻秸秆表面定殖量,结合激光共聚焦显微镜,系统评估标记菌株的生长特性、降解功能及在水稻秸秆表面的定殖规律。 结果 NDSD-Z1-GFP在荧光显微镜下可发出稳定的绿色荧光,其生长曲线与野生株NDSD-Z1及空载体对照株无显著差异,连续传代10次后质粒保留率稳定在79%,遗传稳定性良好。该标记菌株可分泌羧甲基纤维素酶、滤纸酶、内切葡聚糖酶、β-葡萄糖苷酶、木聚糖酶及木质素漆酶,各酶活性峰值出现在发酵第6-12天;在发酵15 d内对水稻秸秆的降解率与野生株无显著差异,并且能有效降解秸秆中的纤维素、半纤维素和木质素。定殖动态研究显示,NDSD-Z1-GFP在水稻秸秆表面的定殖量呈先升后降趋势,第6天达到峰值7.27×10 7 CFU/g,激光共聚焦显微镜观测揭示其在秸秆表面的定殖受微拓扑结构引导,并且随降解进程呈现阶段性分布特征。 结论 标记菌株NDSD-Z1-GFP保留了野生株的生长特性及水稻秸秆降解能力,并且具有良好的遗传稳定性和水稻秸秆定殖能力,为深入研究该菌株的秸秆降解分子机制及微生态定殖规律提供了理想材料。 1 2 3 4 5 6 7 赫晓彤,孙百宁,张爽,董悦,乔晟,晏磊 2026,53(10):5541-5555, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251331 CSTR: 32113.14.j.MC.251331 背景 蒙氏假单胞菌( Pseudomonas mandelii ) NDSD-Z1是一株具有水稻秸秆降解潜力的功能菌株,但其对水稻秸秆的降解特性及降解过程中的表面定殖规律尚未得到系统阐明,制约了对其降解机制的深入解析。 目的 阐明绿色荧光蛋白(green fluorescent protein, GFP)标记菌株的生物学特性、水稻秸秆的降解效能及表面定殖时空分布规律。 方法 以质粒pUC57- sfGFP 为模板克隆 sfGFP 基因,采用无缝克隆技术构建重组质粒pBBR- sfGFP ,利用电击转化法将重组子导入菌株NDSD-Z1后,通过测定标记菌株的生长特性、遗传稳定性、木质纤维素酶活性、秸秆降解能力及其在水稻秸秆表面定殖量,结合激光共聚焦显微镜,系统评估标记菌株的生长特性、降解功能及在水稻秸秆表面的定殖规律。 结果 NDSD-Z1-GFP在荧光显微镜下可发出稳定的绿色荧光,其生长曲线与野生株NDSD-Z1及空载体对照株无显著差异,连续传代10次后质粒保留率稳定在79%,遗传稳定性良好。该标记菌株可分泌羧甲基纤维素酶、滤纸酶、内切葡聚糖酶、β-葡萄糖苷酶、木聚糖酶及木质素漆酶,各酶活性峰值出现在发酵第6-12天;在发酵15 d内对水稻秸秆的降解率与野生株无显著差异,并且能有效降解秸秆中的纤维素、半纤维素和木质素。定殖动态研究显示,NDSD-Z1-GFP在水稻秸秆表面的定殖量呈先升后降趋势,第6天达到峰值7.27×10 7 CFU/g,激光共聚焦显微镜观测揭示其在秸秆表面的定殖受微拓扑结构引导,并且随降解进程呈现阶段性分布特征。 结论 标记菌株NDSD-Z1-GFP保留了野生株的生长特性及水稻秸秆降解能力,并且具有良好的遗传稳定性和水稻秸秆定殖能力,为深入研究该菌株的秸秆降解分子机制及微生态定殖规律提供了理想材料。 茶树叶斑病病原菌 Epicoccum sorghinum 的生物学特性及室内药剂筛选 钟宁云,谭琳,杨艺帅,谢源霜,付子妍,皮鑫鹏,胡秋龙 2026,53(10):5556-5572, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251353 CSTR: 32113.14.j.MC.251353 摘要: (1) HTML (1) PDF (1.92 M)( 3 ) Abstract: 背景 茶树叶斑病是茶树上一类常见且危害性较强的真菌性病害,显著降低了茶园的经济效益。 目的 明确湖南长沙地区茶树叶斑病的致病真菌,并分析其生物学特性及对常用杀菌剂的敏感性,为病害精准防控提供基础数据。 方法 从长沙茶园采集病叶后,采用组织分离法获得病原菌株,并依据柯赫氏法则验证其致病性;结合菌落和孢子形态学特征,以及ITS、 TUB2 和 RPB2 多基因联合的系统发育分析确定病原菌种属。采用十字交叉法和血球计数法分别测定不同温度、pH、光照条件、碳源、氮源对其菌丝生长和产孢的影响;对10种市售杀菌剂的体外抑菌效果进行了评价与比较,并筛选出5种抑制作用较强的药剂,开展了室内毒力测定及离体防效试验。 结果 从病叶中分离得到1株对茶树具有明显致病性的菌株Hunan ES,鉴定为高粱附球菌( Epicoccum sorghinum )。除在40 ℃条件下不能产孢外,其余供试条件下均能观察到菌丝生长和孢子形成。菌丝生长和孢子形成的最适条件较为一致:pH 7.0、温度25 ℃、氮源为酵母提取物;24 h连续光照条件有利于菌丝生长,而不同光照条件下产孢量差异不显著。对碳源的利用存在差异,菌丝生长的最适碳源为麦芽糖,而孢子形成的最适碳源为淀粉。此外,菌丝生长抑制率表明,丙环唑和苯醚甲环唑对茶树叶斑病病原菌 Epicoccum sorghinum 抑制效果较好,抑菌率分别为97.72%和91.62%,其毒力回归方程分别为 y =1.158 0 x +8.235 5和 y =0.919 9 x +7.521 1,半数有效抑制浓度( EC 50 )分别为1.61 mg/L和1.82 mg/L,在4 EC 50 浓度下对离体叶片防效达58.27%和54.66%。 结论 E . sorghinum 是长沙地区茶树叶斑病的重要病原之一,丙环唑和苯醚甲环唑对该菌引起的茶树叶斑病具有较好的防治潜力。本研究为茶树叶斑病的病原明确及化学防治提供了理论依据。 1 2 3 4 5 6 7 8 9 钟宁云,谭琳,杨艺帅,谢源霜,付子妍,皮鑫鹏,胡秋龙 2026,53(10):5556-5572, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251353 CSTR: 32113.14.j.MC.251353 背景 茶树叶斑病是茶树上一类常见且危害性较强的真菌性病害,显著降低了茶园的经济效益。 目的 明确湖南长沙地区茶树叶斑病的致病真菌,并分析其生物学特性及对常用杀菌剂的敏感性,为病害精准防控提供基础数据。 方法 从长沙茶园采集病叶后,采用组织分离法获得病原菌株,并依据柯赫氏法则验证其致病性;结合菌落和孢子形态学特征,以及ITS、 TUB2 和 RPB2 多基因联合的系统发育分析确定病原菌种属。采用十字交叉法和血球计数法分别测定不同温度、pH、光照条件、碳源、氮源对其菌丝生长和产孢的影响;对10种市售杀菌剂的体外抑菌效果进行了评价与比较,并筛选出5种抑制作用较强的药剂,开展了室内毒力测定及离体防效试验。 结果 从病叶中分离得到1株对茶树具有明显致病性的菌株Hunan ES,鉴定为高粱附球菌( Epicoccum sorghinum )。除在40 ℃条件下不能产孢外,其余供试条件下均能观察到菌丝生长和孢子形成。菌丝生长和孢子形成的最适条件较为一致:pH 7.0、温度25 ℃、氮源为酵母提取物;24 h连续光照条件有利于菌丝生长,而不同光照条件下产孢量差异不显著。对碳源的利用存在差异,菌丝生长的最适碳源为麦芽糖,而孢子形成的最适碳源为淀粉。此外,菌丝生长抑制率表明,丙环唑和苯醚甲环唑对茶树叶斑病病原菌 Epicoccum sorghinum 抑制效果较好,抑菌率分别为97.72%和91.62%,其毒力回归方程分别为 y =1.158 0 x +8.235 5和 y =0.919 9 x +7.521 1,半数有效抑制浓度( EC 50 )分别为1.61 mg/L和1.82 mg/L,在4 EC 50 浓度下对离体叶片防效达58.27%和54.66%。 结论 E . sorghinum 是长沙地区茶树叶斑病的重要病原之一,丙环唑和苯醚甲环唑对该菌引起的茶树叶斑病具有较好的防治潜力。本研究为茶树叶斑病的病原明确及化学防治提供了理论依据。 耐低温木质素降解菌 Stenotrophomonas sp. DL-1 的分离、鉴定及对秸秆降解效果 张琳,王敬红,邹世杰,卢磊,杨洪岩,王伟东 2026,53(10):5573-5589, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251354 CSTR: 32113.14.j.MC.251354 摘要: (1) HTML (4) PDF (3.22 M)( 2 ) Abstract: 背景 低温条件下土壤微生物活性受抑制,是导致寒地秸秆还田降解效率低下的核心限制因素。目前报道的高效降解菌株多适用于中温环境,低温适用的菌种资源依然匮乏。 目的 分离耐低温且具有木质素降解能力的菌株,研究其耐低温降解特性及对低温条件下秸秆降解的促进效果。 方法 采用苯胺蓝筛选方法从富集培养物中分离目标菌株,测定其生长特性和秸秆降解率。结合生理生化试验和16S rRNA基因序列分析对其进行鉴定;通过盆栽模拟试验测定其对秸秆降解、土壤理化性质及微生物群落结构的影响。 结果 分离到1株木质素降解菌株DL-1,初步鉴定为寡养单胞菌( Stenotrophomonas sp.)。该菌在15 ℃条件下对秸秆降解率达13.54%,木质素降解率为32.92%。盆栽试验表明,菌剂DL-1的施加可显著促进寒地模拟条件下水稻秸秆的降解进程,培养60 d时秸秆降解率达36.1%,培养至90 d时降解率进一步提升至44.7%,相较于对照组均表现出明显的促降解优势。同时,处理组土壤全氮含量较对照组显著提高11.7%。菌剂处理显著改变了土壤细菌群落结构[置换多元方差分析(permutational multivariate analysis of variance, PERMANOVA), P <0.001]。关键差异物种分析表明,处理组特异性富集了类诺卡氏菌属( Nocardioides ) [线性判别分析(linear discriminant analysis, LDA)得分>4.9],而外源菌剂所属的寡养单胞菌属( Stenotrophomonas )未成为优势类群。 结论 耐低温木质素降解菌 Stenotrophomonas sp. DL-1能有效加速寒地秸秆降解,通过激发土壤中固有的 Nocardioides 、鞘胺醇单胞菌属( Sphingomonas )等菌属的降解活性,驱动秸秆降解进程,该研究为寒地秸秆降解提供了新视角。 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 张琳,王敬红,邹世杰,卢磊,杨洪岩,王伟东 2026,53(10):5573-5589, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251354 CSTR: 32113.14.j.MC.251354 背景 低温条件下土壤微生物活性受抑制,是导致寒地秸秆还田降解效率低下的核心限制因素。目前报道的高效降解菌株多适用于中温环境,低温适用的菌种资源依然匮乏。 目的 分离耐低温且具有木质素降解能力的菌株,研究其耐低温降解特性及对低温条件下秸秆降解的促进效果。 方法 采用苯胺蓝筛选方法从富集培养物中分离目标菌株,测定其生长特性和秸秆降解率。结合生理生化试验和16S rRNA基因序列分析对其进行鉴定;通过盆栽模拟试验测定其对秸秆降解、土壤理化性质及微生物群落结构的影响。 结果 分离到1株木质素降解菌株DL-1,初步鉴定为寡养单胞菌( Stenotrophomonas sp.)。该菌在15 ℃条件下对秸秆降解率达13.54%,木质素降解率为32.92%。盆栽试验表明,菌剂DL-1的施加可显著促进寒地模拟条件下水稻秸秆的降解进程,培养60 d时秸秆降解率达36.1%,培养至90 d时降解率进一步提升至44.7%,相较于对照组均表现出明显的促降解优势。同时,处理组土壤全氮含量较对照组显著提高11.7%。菌剂处理显著改变了土壤细菌群落结构[置换多元方差分析(permutational multivariate analysis of variance, PERMANOVA), P <0.001]。关键差异物种分析表明,处理组特异性富集了类诺卡氏菌属( Nocardioides ) [线性判别分析(linear discriminant analysis, LDA)得分>4.9],而外源菌剂所属的寡养单胞菌属( Stenotrophomonas )未成为优势类群。 结论 耐低温木质素降解菌 Stenotrophomonas sp. DL-1能有效加速寒地秸秆降解,通过激发土壤中固有的 Nocardioides 、鞘胺醇单胞菌属( Sphingomonas )等菌属的降解活性,驱动秸秆降解进程,该研究为寒地秸秆降解提供了新视角。 五株植物促生细菌对小白菜生长及根际微生态的影响 李倩,张晶,习彦花,何晓亮,程辉彩 2026,53(10):5590-5604, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251365 CSTR: 32113.14.j.MC.251365 摘要: (1) HTML (4) PDF (2.55 M)( 3 ) Abstract: 背景 小白菜在我国蔬菜产业中占据重要地位,但生产中普遍依赖化肥以追求高产。 目的 探究不同的植物促生菌对小白菜生长及根际微生态的影响。 方法 温室盆栽条件下,对小白菜施加不同植物促生菌处理,测量其生长指标、土壤的理化性质及根际微生物群落组成。 结果 5种植物促生细菌能够显著增加小白菜的干重和叶片长度;固氮螺菌( Azospirillum sp.) I102、马假节杆菌( Pseudarthrobacter equi ) GD26和植物内生谷氨酸杆菌( Glutamicibacter endophyticus ) CL2能显著增加小白菜的根长;马假节杆菌GD26、多点假节杆菌( P . quantipunctorum ) CL1和植物内生谷氨酸杆菌CL2能显著增加小白菜叶绿素含量。施用植物促生菌后,土壤氨态氮含量显著提高,其中固氮螺菌I102处理组土壤氨态氮含量增加56.8%,显著高于其他处理组。广东假杜擀氏菌( Pseudoduganella guangdongensis ) GD22处理组土壤有机质含量较对照组提高35.6% ( P <0.05)。固氮螺菌I102、马假节杆菌GD26、多点假节杆菌CL1和植物内生谷氨酸杆菌CL2处理组根际微生物多样性降低,微生物群落结构与对照组有显著差异。在门水平上,小白菜根际主要的微生物类群为变形菌门( Proteobacteria )、放线菌门( Actinomycetota )、拟杆菌门( Bacteroidota )、绿弯菌门( Chloroflexi )和厚壁菌门( Firmicutes )。施用固氮螺菌I102、马假节杆菌GD26和植物内生谷氨酸杆菌CL2后,分别显著提高拟杆菌门、蓝细菌门( Cyanobacteria )和放线菌门的微生物相对丰度。相关性分析显示,厚壁菌门等菌群与土壤硝态氮和速效钾含量密切相关,土壤红色杆形菌目( Solirubrobacterales )、吞食杆菌属( Peredibacter )等微生物的相对丰度与土壤有效磷、硝态氮、速效钾含量显著正相关。 结论 5株植物促生细菌通过改善土壤肥力、改变根际微生物群落结构,促进小白菜的生长。 1 2 3 4 5 6 7 李倩,张晶,习彦花,何晓亮,程辉彩 2026,53(10):5590-5604, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251365 CSTR: 32113.14.j.MC.251365 背景 小白菜在我国蔬菜产业中占据重要地位,但生产中普遍依赖化肥以追求高产。 目的 探究不同的植物促生菌对小白菜生长及根际微生态的影响。 方法 温室盆栽条件下,对小白菜施加不同植物促生菌处理,测量其生长指标、土壤的理化性质及根际微生物群落组成。 结果 5种植物促生细菌能够显著增加小白菜的干重和叶片长度;固氮螺菌( Azospirillum sp.) I102、马假节杆菌( Pseudarthrobacter equi ) GD26和植物内生谷氨酸杆菌( Glutamicibacter endophyticus ) CL2能显著增加小白菜的根长;马假节杆菌GD26、多点假节杆菌( P . quantipunctorum ) CL1和植物内生谷氨酸杆菌CL2能显著增加小白菜叶绿素含量。施用植物促生菌后,土壤氨态氮含量显著提高,其中固氮螺菌I102处理组土壤氨态氮含量增加56.8%,显著高于其他处理组。广东假杜擀氏菌( Pseudoduganella guangdongensis ) GD22处理组土壤有机质含量较对照组提高35.6% ( P <0.05)。固氮螺菌I102、马假节杆菌GD26、多点假节杆菌CL1和植物内生谷氨酸杆菌CL2处理组根际微生物多样性降低,微生物群落结构与对照组有显著差异。在门水平上,小白菜根际主要的微生物类群为变形菌门( Proteobacteria )、放线菌门( Actinomycetota )、拟杆菌门( Bacteroidota )、绿弯菌门( Chloroflexi )和厚壁菌门( Firmicutes )。施用固氮螺菌I102、马假节杆菌GD26和植物内生谷氨酸杆菌CL2后,分别显著提高拟杆菌门、蓝细菌门( Cyanobacteria )和放线菌门的微生物相对丰度。相关性分析显示,厚壁菌门等菌群与土壤硝态氮和速效钾含量密切相关,土壤红色杆形菌目( Solirubrobacterales )、吞食杆菌属( Peredibacter )等微生物的相对丰度与土壤有效磷、硝态氮、速效钾含量显著正相关。 结论 5株植物促生细菌通过改善土壤肥力、改变根际微生物群落结构,促进小白菜的生长。 一种洋葱基盘腐烂病防病降盐碱复合菌系的构建及其效应 孟欢,许世洋,漆永红,黄峥,李建军,李雪萍 2026,53(10):5605-5620, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251369 CSTR: 32113.14.j.MC.251369 摘要: (1) HTML (3) PDF (2.47 M)( 1 ) Abstract: 背景 洋葱主产区土壤盐碱化严重,以及集约化种植、连作等因素致使洋葱基盘腐烂病频发,洋葱品质和产量受到了极大的影响,目前尚缺乏绿色有效防控技术。 目的 获得具有降解盐碱效果、防治洋葱基盘腐烂病、促进洋葱生长作用的复合微生物菌剂。 方法 采集洋葱根际土壤,通过选择性培养法筛选降盐碱及耐盐碱菌株,硝酸盐滴定法及pH酸度计法测定其降盐碱特性。选取特性优良的降盐碱菌及实验室前期筛选得到的生防菌、促生菌,采用平板对峙法测定各菌株之间的亲和性,选取亲和性良好的不同功能菌株进行复配形成复合菌系。采用凯氏定氮法测定各复合菌系的固氮量、钼锑抗比色法测定溶磷量、火焰原子吸收光谱法测定解钾量,Topsis综合分析得到最优复合菌系。通过分析复合菌系所涉及各菌株16S rRNA基因序列确定其分类地位,同时优化其配比,最后通过室内盆栽法明确最优复合菌系的降盐碱、防病及促生效应。 结果 共筛选得到20株降盐碱菌,4株耐盐能力较强菌株,3株耐碱能力较强菌株,其中菌株LAB2、LAB3.2为盐碱同时耐受菌株,菌株LAB3.2、LAB2、MX38降碱效果显著,降碱率为(12.3-17.6)%,菌株SYP202、LAB2、MFL22、MX50降盐效果较好,降盐率分别为19.26%、17.75%、10.61%、11.26%。构建形成的3组复合菌系中,A2复合菌系溶有机磷能力最强,为325.4 μg/mL;A1复合菌系固氮效能最好,为0.394 g/L;综合分析得到A3复合菌系综合性能最优,其解钾量为99.13 mg/L,固氮量为0.225 g/L,铁载体活性单位( su )值为39.54,分泌吲哚乙酸(indole-3-acetic acid, IAA)量为10.66 mg/L,对洋葱基盘腐烂病优势病原尖孢镰刀菌( Fusarium oxysporum )的抑菌率达95.15%。菌株LAB2被鉴定为松鼠葡萄球菌( Staphylococcus sciuri )、菌株LAB3.2被鉴定为乙酰微小杆菌( Exiguobacterium acetylicum )。优化得到复合菌系菌株M3:LAB3.2:LAB2:MP6:SYP202最佳配比为9:9:3:7:5。测定其效应发现,最优复合菌系A3对洋葱基盘腐烂病的防效为73.3%,土壤pH下降了0.5、可溶性盐浓度下降了44.46 ms/cm,并且洋葱株高、茎粗、根长均有不同程度的增加。 结论 本研究所构建的复合菌系具有良好的降解盐碱功效,对洋葱基盘腐烂病防效良好,促生作用显著。 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 孟欢,许世洋,漆永红,黄峥,李建军,李雪萍 2026,53(10):5605-5620, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251369 CSTR: 32113.14.j.MC.251369 背景 洋葱主产区土壤盐碱化严重,以及集约化种植、连作等因素致使洋葱基盘腐烂病频发,洋葱品质和产量受到了极大的影响,目前尚缺乏绿色有效防控技术。 目的 获得具有降解盐碱效果、防治洋葱基盘腐烂病、促进洋葱生长作用的复合微生物菌剂。 方法 采集洋葱根际土壤,通过选择性培养法筛选降盐碱及耐盐碱菌株,硝酸盐滴定法及pH酸度计法测定其降盐碱特性。选取特性优良的降盐碱菌及实验室前期筛选得到的生防菌、促生菌,采用平板对峙法测定各菌株之间的亲和性,选取亲和性良好的不同功能菌株进行复配形成复合菌系。采用凯氏定氮法测定各复合菌系的固氮量、钼锑抗比色法测定溶磷量、火焰原子吸收光谱法测定解钾量,Topsis综合分析得到最优复合菌系。通过分析复合菌系所涉及各菌株16S rRNA基因序列确定其分类地位,同时优化其配比,最后通过室内盆栽法明确最优复合菌系的降盐碱、防病及促生效应。 结果 共筛选得到20株降盐碱菌,4株耐盐能力较强菌株,3株耐碱能力较强菌株,其中菌株LAB2、LAB3.2为盐碱同时耐受菌株,菌株LAB3.2、LAB2、MX38降碱效果显著,降碱率为(12.3-17.6)%,菌株SYP202、LAB2、MFL22、MX50降盐效果较好,降盐率分别为19.26%、17.75%、10.61%、11.26%。构建形成的3组复合菌系中,A2复合菌系溶有机磷能力最强,为325.4 μg/mL;A1复合菌系固氮效能最好,为0.394 g/L;综合分析得到A3复合菌系综合性能最优,其解钾量为99.13 mg/L,固氮量为0.225 g/L,铁载体活性单位( su )值为39.54,分泌吲哚乙酸(indole-3-acetic acid, IAA)量为10.66 mg/L,对洋葱基盘腐烂病优势病原尖孢镰刀菌( Fusarium oxysporum )的抑菌率达95.15%。菌株LAB2被鉴定为松鼠葡萄球菌( Staphylococcus sciuri )、菌株LAB3.2被鉴定为乙酰微小杆菌( Exiguobacterium acetylicum )。优化得到复合菌系菌株M3:LAB3.2:LAB2:MP6:SYP202最佳配比为9:9:3:7:5。测定其效应发现,最优复合菌系A3对洋葱基盘腐烂病的防效为73.3%,土壤pH下降了0.5、可溶性盐浓度下降了44.46 ms/cm,并且洋葱株高、茎粗、根长均有不同程度的增加。 结论 本研究所构建的复合菌系具有良好的降解盐碱功效,对洋葱基盘腐烂病防效良好,促生作用显著。 贝莱斯芽孢杆菌 LE-B7 的全基因组分析及对牛油果根腐病的拮抗机理 李琳,李国琳,安林满,王成先 2026,53(10):5621-5637, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260006 CSTR: 32113.14.j.MC.260006 摘要: (1) HTML (2) PDF (2.80 M)( 2 ) Abstract: 背景 牛油果( Persea americana Mill.)根腐病严重威胁其可持续种植,利用有益微生物进行生物防治是极具潜力的绿色防控途径。 目的 筛选对牛油果根腐病原菌具有高效拮抗作用的根际细菌,解析其分类地位及抑菌分子机制,为该病害防控提供优良菌种资源。 方法 采用稀释涂布法和平板对峙法从健康牛油果根际土壤中筛选拮抗细菌。结合形态学、生理生化特征、16S rRNA和 gyrA 基因分子鉴定,以及全基因组系统发育分析确定菌株的分类地位。完成菌株全基因组测序,使用antiSMASH软件挖掘次级代谢产物生物合成基因簇。通过液相色谱-串联质谱技术分析发酵液中的活性成分。结合胞外酶活、促生能力检测,配合显微观察、土壤施用及离体茎段接种试验,从分子、细胞及微生态水平揭示其生防机理。 结果 筛选获得1株高效拮抗菌株LE-B7,对根腐病原镰刀菌( Fusarium sp.)的平板抑菌率达(63.0±2.4)%。经综合鉴定,确认该菌株为贝莱斯芽孢杆菌( Bacillus velezensis )。全基因组分析表明菌株LE-B7含有14个次级代谢产物生物合成基因簇。LC-MS/MS检测到表面活性素、布昔霉素A及铁载体芽孢杆菌素,与基因组预测结果高度吻合。平板及生化检测证实菌株LE-B7具备分泌蛋白酶、纤维素酶及淀粉酶活性,并表现出显著的产铁载体、解磷及合成吲哚-3-乙酸(indole-3-acetic acid, IAA)的能力。显微观察表明,菌株LE-B7分泌的活性物质能破坏病原菌细胞膜完整性并导致菌丝畸形。土壤施用试验表明,菌株LE-B7能有效增加土壤中芽孢杆菌数量并显著降低镰刀菌数量;离体茎段接种试验也进一步证实了其对病原侵染的阻断作用。 结论 贝莱斯芽孢杆菌LE-B7具备良好的土壤定殖潜力,通过“胞外酶解-膜损伤-抗生素抑菌-营养竞争”的多重协同机制发挥作用,具有重要的开发与应用价值。 1 2 3 4 5 6 7 2026,53(10):5621-5637, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260006 CSTR: 32113.14.j.MC.260006 背景 牛油果( Persea americana Mill.)根腐病严重威胁其可持续种植,利用有益微生物进行生物防治是极具潜力的绿色防控途径。 目的 筛选对牛油果根腐病原菌具有高效拮抗作用的根际细菌,解析其分类地位及抑菌分子机制,为该病害防控提供优良菌种资源。 方法 采用稀释涂布法和平板对峙法从健康牛油果根际土壤中筛选拮抗细菌。结合形态学、生理生化特征、16S rRNA和 gyrA 基因分子鉴定,以及全基因组系统发育分析确定菌株的分类地位。完成菌株全基因组测序,使用antiSMASH软件挖掘次级代谢产物生物合成基因簇。通过液相色谱-串联质谱技术分析发酵液中的活性成分。结合胞外酶活、促生能力检测,配合显微观察、土壤施用及离体茎段接种试验,从分子、细胞及微生态水平揭示其生防机理。 结果 筛选获得1株高效拮抗菌株LE-B7,对根腐病原镰刀菌( Fusarium sp.)的平板抑菌率达(63.0±2.4)%。经综合鉴定,确认该菌株为贝莱斯芽孢杆菌( Bacillus velezensis )。全基因组分析表明菌株LE-B7含有14个次级代谢产物生物合成基因簇。LC-MS/MS检测到表面活性素、布昔霉素A及铁载体芽孢杆菌素,与基因组预测结果高度吻合。平板及生化检测证实菌株LE-B7具备分泌蛋白酶、纤维素酶及淀粉酶活性,并表现出显著的产铁载体、解磷及合成吲哚-3-乙酸(indole-3-acetic acid, IAA)的能力。显微观察表明,菌株LE-B7分泌的活性物质能破坏病原菌细胞膜完整性并导致菌丝畸形。土壤施用试验表明,菌株LE-B7能有效增加土壤中芽孢杆菌数量并显著降低镰刀菌数量;离体茎段接种试验也进一步证实了其对病原侵染的阻断作用。 结论 贝莱斯芽孢杆菌LE-B7具备良好的土壤定殖潜力,通过“胞外酶解-膜损伤-抗生素抑菌-营养竞争”的多重协同机制发挥作用,具有重要的开发与应用价值。 具有降血脂、血糖潜力的动物源乳酸菌鉴定筛选与功能评价 王亚雯,徐莉莉,吕红珍,张琳,谭镇炜,高敏,原丽红,何宏轩,齐永华,赵瑞利,王承民 2026,53(10):5638-5654, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260004 CSTR: 32113.14.j.MC.260004 摘要: (1) HTML (4) PDF (2.42 M)( 1 ) Abstract: 背景 代谢性疾病在动物中发病率上升,具有调控脂质和糖代谢潜能的动物源益生乳酸菌研究仍较为有限。 目的 从动物源样品中筛选具有降血脂、降血糖潜力的益生乳酸菌,并对其功能特性及安全性进行系统评价。 方法 通过产酸能力初筛分离株,接着采用胆盐水解酶定性与定量、体外胆固醇清除、α-淀粉酶和α-葡萄糖苷酶抑制实验评价其降血脂血糖相关活性并进行复筛;结合形态学特征及16S rRNA基因序列分析进行菌株鉴定;进一步对筛选菌株的有机酸代谢特性、生长特性、耐酸耐胆盐能力、抑菌活性、黏附特性、抗氧化能力及安全性进行综合分析。 结果 经初筛、复筛得到具有较好降血脂血糖潜力的1株罗伊特氏黏液乳杆菌( Limosilactobacillus reuteri ),命名为 Li . reuteri 4434-2aT和1株约翰逊氏乳杆菌( Lactobacillus johnsonii ),命名为 La . johnsonii 4437-4AT。其中 Li . reuteri 4434-2aT的胆固醇清除率最高为55.94%, La . johnsonii 4437-4AT对α-淀粉酶抑制率为54.60%。进一步研究发现2株乳酸菌可产生乙酸、丙酸等与脂质和糖代谢调控相关的有机酸,生长稳定且在酸性和胆盐环境中表现出一定耐受能力,对4种及以上常见病原菌具有抑菌活性,表面疏水率大于50%,DPPH自由基清除率大于90%,同时无溶血性,对多种抗生素呈敏感或中介表型。 结论 动物源乳酸菌中存在具有潜在调控脂质和糖代谢功能的益生菌株, Li . reuteri 4434-2aT和 La . johnsonii 4437-4AT表现出较好的综合功能特性,可作为后续机制研究及动物代谢健康调控的候选菌株。 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 王亚雯,徐莉莉,吕红珍,张琳,谭镇炜,高敏,原丽红,何宏轩,齐永华,赵瑞利,王承民 2026,53(10):5638-5654, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260004 CSTR: 32113.14.j.MC.260004 背景 代谢性疾病在动物中发病率上升,具有调控脂质和糖代谢潜能的动物源益生乳酸菌研究仍较为有限。 目的 从动物源样品中筛选具有降血脂、降血糖潜力的益生乳酸菌,并对其功能特性及安全性进行系统评价。 方法 通过产酸能力初筛分离株,接着采用胆盐水解酶定性与定量、体外胆固醇清除、α-淀粉酶和α-葡萄糖苷酶抑制实验评价其降血脂血糖相关活性并进行复筛;结合形态学特征及16S rRNA基因序列分析进行菌株鉴定;进一步对筛选菌株的有机酸代谢特性、生长特性、耐酸耐胆盐能力、抑菌活性、黏附特性、抗氧化能力及安全性进行综合分析。 结果 经初筛、复筛得到具有较好降血脂血糖潜力的1株罗伊特氏黏液乳杆菌( Limosilactobacillus reuteri ),命名为 Li . reuteri 4434-2aT和1株约翰逊氏乳杆菌( Lactobacillus johnsonii ),命名为 La . johnsonii 4437-4AT。其中 Li . reuteri 4434-2aT的胆固醇清除率最高为55.94%, La . johnsonii 4437-4AT对α-淀粉酶抑制率为54.60%。进一步研究发现2株乳酸菌可产生乙酸、丙酸等与脂质和糖代谢调控相关的有机酸,生长稳定且在酸性和胆盐环境中表现出一定耐受能力,对4种及以上常见病原菌具有抑菌活性,表面疏水率大于50%,DPPH自由基清除率大于90%,同时无溶血性,对多种抗生素呈敏感或中介表型。 结论 动物源乳酸菌中存在具有潜在调控脂质和糖代谢功能的益生菌株, Li . reuteri 4434-2aT和 La . johnsonii 4437-4AT表现出较好的综合功能特性,可作为后续机制研究及动物代谢健康调控的候选菌株。 两株牛乳源马肠链球菌的生物学特性及全基因组序列比较分析 宋丹丹,田裕辉,彭靖轩,蒋新宇,周宏远,张宝江,苏艳 2026,53(10):5655-5672, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251336 CSTR: 32113.14.j.MC.251336 摘要: (1) HTML (3) PDF (5.04 M)( 3 ) Abstract: 背景 马肠链球菌( Streptococcus equinus )为D群链球菌中的一种机会性致病菌,也是人兽共患病病原,分析其基因组特征和潜在致病性,可为该菌引发感染的防控提供参考。 目的 从牛乳源分离纯化得到2株马肠链球菌,对分离株进行全基因组测序,了解其基因组的基本特征,明确该菌的分子进化规律。 方法 获得的2株马肠链球菌菌株分别命名为XJNL131和XJNL132,并对其进行生长曲线、生物膜形成、药物敏感性和对小鼠毒力的检测和比较。利用二代测序技术对分离菌株进行全基因组测序和基因序列分型,采用测序数据与数据库中已有序列构建基因组进化树及多位点序列分型(multiple locus sequence type, MLST)进化树,利用毒力因子数据库(virulence factor database, VFDB)和综合抗性基因数据库(comprehensive antibiotic resistance database, CARD)数据库对2株菌的毒力基因和耐药基因进行注释和比较。 结果 菌株XJNL131和菌株XJNL132基因组大小分别为1 869 751 bp和1 878 769 bp,分别有1 766与1 781个编码区,菌株XJNL131携带有216个毒力基因,菌株XJNL132携带有217个毒力基因;菌株XJNL131共有257个耐药基因,菌株XJNL132共有258个耐药基因。菌株XJNL131、菌株XJNL132的基因型均为新发现基因型ST240。基因组进化树显示菌株XJNL131、菌株XJNL132与牛源 Streptococcus equinus (JB1, ATCC 33317, NM-7, CNU 77-23)、人源 Streptococcus equinus 菌株(MGYG-HGU-0313, NCTC8133)、牛源瘤胃链球菌( Streptococcus ruminicola ) CNU-G2和人源瘤胃链球菌( Streptococcus ruminicola ) CNU_77-47亲缘关系最近。MLST系统进化树显示菌株XJNL131、XJNL132 (ST240)与人源(ST62)、鹿源(ST33)马肠链球菌分离株亲缘关系较近。菌株XJNL131对4种抗生素耐药,菌株XJNL132对1种抗生素耐药。结晶紫法检测表明,菌株XJNL131生物膜形成能力显著高于菌株XJNL132 ( P <0.05);菌体载量结果表明,2株菌对脾脏的侵袭力明显高于肝脏。而菌株XJNL131的小鼠脾组织荷菌量极显著高于菌株XJNL132 ( P <0.01),并且对小鼠脾脏病理损伤更严重。 结论 本研究分离出2株牛乳源马肠链球菌XJNL131和XJNL132,均为新基因型ST240,其中菌株XJNL132携带毒力和耐药基因多,致病表型更强;菌株XJNL131生物膜形成能力强,耐药表型显著。研究结果为牛源马肠链球菌的疾病防治、流行与公共卫生提供参考资料。 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 宋丹丹,田裕辉,彭靖轩,蒋新宇,周宏远,张宝江,苏艳 2026,53(10):5655-5672, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251336 CSTR: 32113.14.j.MC.251336 背景 马肠链球菌( Streptococcus equinus )为D群链球菌中的一种机会性致病菌,也是人兽共患病病原,分析其基因组特征和潜在致病性,可为该菌引发感染的防控提供参考。 目的 从牛乳源分离纯化得到2株马肠链球菌,对分离株进行全基因组测序,了解其基因组的基本特征,明确该菌的分子进化规律。 方法 获得的2株马肠链球菌菌株分别命名为XJNL131和XJNL132,并对其进行生长曲线、生物膜形成、药物敏感性和对小鼠毒力的检测和比较。利用二代测序技术对分离菌株进行全基因组测序和基因序列分型,采用测序数据与数据库中已有序列构建基因组进化树及多位点序列分型(multiple locus sequence type, MLST)进化树,利用毒力因子数据库(virulence factor database, VFDB)和综合抗性基因数据库(comprehensive antibiotic resistance database, CARD)数据库对2株菌的毒力基因和耐药基因进行注释和比较。 结果 菌株XJNL131和菌株XJNL132基因组大小分别为1 869 751 bp和1 878 769 bp,分别有1 766与1 781个编码区,菌株XJNL131携带有216个毒力基因,菌株XJNL132携带有217个毒力基因;菌株XJNL131共有257个耐药基因,菌株XJNL132共有258个耐药基因。菌株XJNL131、菌株XJNL132的基因型均为新发现基因型ST240。基因组进化树显示菌株XJNL131、菌株XJNL132与牛源 Streptococcus equinus (JB1, ATCC 33317, NM-7, CNU 77-23)、人源 Streptococcus equinus 菌株(MGYG-HGU-0313, NCTC8133)、牛源瘤胃链球菌( Streptococcus ruminicola ) CNU-G2和人源瘤胃链球菌( Streptococcus ruminicola ) CNU_77-47亲缘关系最近。MLST系统进化树显示菌株XJNL131、XJNL132 (ST240)与人源(ST62)、鹿源(ST33)马肠链球菌分离株亲缘关系较近。菌株XJNL131对4种抗生素耐药,菌株XJNL132对1种抗生素耐药。结晶紫法检测表明,菌株XJNL131生物膜形成能力显著高于菌株XJNL132 ( P <0.05);菌体载量结果表明,2株菌对脾脏的侵袭力明显高于肝脏。而菌株XJNL131的小鼠脾组织荷菌量极显著高于菌株XJNL132 ( P <0.01),并且对小鼠脾脏病理损伤更严重。 结论 本研究分离出2株牛乳源马肠链球菌XJNL131和XJNL132,均为新基因型ST240,其中菌株XJNL132携带毒力和耐药基因多,致病表型更强;菌株XJNL131生物膜形成能力强,耐药表型显著。研究结果为牛源马肠链球菌的疾病防治、流行与公共卫生提供参考资料。 海藻共附生真菌产黄青霉 GXIMD 02523 的次级代谢产物及其抗菌活性 吴杨翃宇,陈春梅,齐鑫,陆雅琪,刘永宏,周雪峰,罗小卫 2026,53(10):5673-5688, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251317 CSTR: 32113.14.j.MC.251317 摘要: (1) HTML (2) PDF (1.85 M)( 1 ) Abstract: 背景 海藻共附生真菌能够产生结构新颖且活性显著的次级代谢产物,是药物先导化合物的重要来源。 目的 开展一株北部湾海藻共附生产黄青霉( Penicillium chrysogenum ) GXIMD 02523的次级代谢产物及其抗菌活性研究。 方法 化合物分离纯化采用多种现代色谱分离技术,运用核磁共振技术和文献数据对比解析化合物的结构,新化合物 1 采用手性柱拆分并利用电子圆二色光谱(electronic circular dichroism, ECD)计算确定其绝对构型。 结果 从菌株 P . chrysogenum GXIMD 02523的次级代谢产物中分离鉴定了19个化合物,分别为(+)-联苯酮C [(+)-orbiophenone C] ( 1a )、(-)-联苯酮C ( 1b )、2-(2,6-二羟基苯甲酰基)-3-羟基-5-(羟甲基)苯甲酸甲酯[benzoic acid, 2-(2,6-dihydroxybenzoyl)-3-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-methyl, methyl ester] ( 2 )、联苯酮B (orbiophenone B) ( 3 )、麦角色素E (ergochrome E) ( 4 )、金氧杂蒽酮G (chrysoxanthone G) ( 5 )、金氧杂蒽酮B (chrysoxanthone B) ( 6 )、金氧杂蒽酮C (chrysoxanthone C) ( 7 )、谢卡酸B (secalonic acid B) ( 8 )、青霉酮A (penicillixanthone A) ( 9 )、谢卡酸F1 (secalonic acid F1) ( 10 )、青霉柠檬素A (penicillocitren A) ( 11 )、青霉酮C (penicillone C) ( 12 )、7-羟基-2-(2ʹ-羟丙基)-5-甲基色酮[7-hydroxy-2-(2ʹ-hydroxypropyl)-5-methylchromone] ( 13 )、2,5-二甲基-7-羟基色酮[2,5-dimethyl-7-hydroxychromone] ( 14 )、原儿茶酸(protocatechuic acid) ( 15 )、ω-羟基大黄素(ω-hydroxyemodin) ( 16 )、大黄素(emodin) ( 17 )、内果红菌素(endocrocin) ( 18 )和异黑麦菌素(isomeleagrin) ( 19 )。化合物 8 的化学结构及构型利用X-射线单晶衍射进行确定。化合物 4 - 7 具有抑制枯草芽孢杆菌( Bacillus subtilis )和表皮葡萄球菌( Staphylococcus epidermidis )作用,最小抑菌浓度(minimal inhibitory concentration, MIC)值为1.95-62.5 μg/mL,化合物 8 - 10 具有抑制枯草芽孢杆菌( Bacillus subtilis )、表皮葡萄球菌( Staphylococcus epidermidis )和金黄色葡萄球菌( Staphylococcus aureus )的作用,MIC值为0.122-3.91 μg/mL。 结论 化合物 1 为1对新的对映异构体,化合物 4 、 10 和 12 首次从 P . chrysogenum 中发现,化合物 4 - 10 具有抗菌活性。 1 2 3 4 5 吴杨翃宇,陈春梅,齐鑫,陆雅琪,刘永宏,周雪峰,罗小卫 2026,53(10):5673-5688, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251317 CSTR: 32113.14.j.MC.251317 背景 海藻共附生真菌能够产生结构新颖且活性显著的次级代谢产物,是药物先导化合物的重要来源。 目的 开展一株北部湾海藻共附生产黄青霉( Penicillium chrysogenum ) GXIMD 02523的次级代谢产物及其抗菌活性研究。 方法 化合物分离纯化采用多种现代色谱分离技术,运用核磁共振技术和文献数据对比解析化合物的结构,新化合物 1 采用手性柱拆分并利用电子圆二色光谱(electronic circular dichroism, ECD)计算确定其绝对构型。 结果 从菌株 P . chrysogenum GXIMD 02523的次级代谢产物中分离鉴定了19个化合物,分别为(+)-联苯酮C [(+)-orbiophenone C] ( 1a )、(-)-联苯酮C ( 1b )、2-(2,6-二羟基苯甲酰基)-3-羟基-5-(羟甲基)苯甲酸甲酯[benzoic acid, 2-(2,6-dihydroxybenzoyl)-3-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-methyl, methyl ester] ( 2 )、联苯酮B (orbiophenone B) ( 3 )、麦角色素E (ergochrome E) ( 4 )、金氧杂蒽酮G (chrysoxanthone G) ( 5 )、金氧杂蒽酮B (chrysoxanthone B) ( 6 )、金氧杂蒽酮C (chrysoxanthone C) ( 7 )、谢卡酸B (secalonic acid B) ( 8 )、青霉酮A (penicillixanthone A) ( 9 )、谢卡酸F1 (secalonic acid F1) ( 10 )、青霉柠檬素A (penicillocitren A) ( 11 )、青霉酮C (penicillone C) ( 12 )、7-羟基-2-(2ʹ-羟丙基)-5-甲基色酮[7-hydroxy-2-(2ʹ-hydroxypropyl)-5-methylchromone] ( 13 )、2,5-二甲基-7-羟基色酮[2,5-dimethyl-7-hydroxychromone] ( 14 )、原儿茶酸(protocatechuic acid) ( 15 )、ω-羟基大黄素(ω-hydroxyemodin) ( 16 )、大黄素(emodin) ( 17 )、内果红菌素(endocrocin) ( 18 )和异黑麦菌素(isomeleagrin) ( 19 )。化合物 8 的化学结构及构型利用X-射线单晶衍射进行确定。化合物 4 - 7 具有抑制枯草芽孢杆菌( Bacillus subtilis )和表皮葡萄球菌( Staphylococcus epidermidis )作用,最小抑菌浓度(minimal inhibitory concentration, MIC)值为1.95-62.5 μg/mL,化合物 8 - 10 具有抑制枯草芽孢杆菌( Bacillus subtilis )、表皮葡萄球菌( Staphylococcus epidermidis )和金黄色葡萄球菌( Staphylococcus aureus )的作用,MIC值为0.122-3.91 μg/mL。 结论 化合物 1 为1对新的对映异构体,化合物 4 、 10 和 12 首次从 P . chrysogenum 中发现,化合物 4 - 10 具有抗菌活性。 印度巨球形菌 XA-511 培养基及小试发酵条件优化 李艳红,卢浩鹏,胡晓云,谭验,朱宁 2026,53(10):5689-5708, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260344 CSTR: 32113.14.j.MC.260344 摘要: (1) HTML (3) PDF (2.88 M)( 2 ) Abstract: 背景 印度巨球形菌( Megasphaera indica )是从健康人类粪便中分离的专性厌氧革兰氏阴性球菌,基因组分析显示其具有多项特异适应人类肠道的特征(丰富CAZymes、胆汁耐受、多药外排泵),提示其在肠道健康中具有潜在重要作用。然而,目前尚无该菌发酵工艺优化的相关研究,制约了其研究与应用的深入开展。 目的 优化 M . indica 液体发酵工艺,提高其培养密度,为后续研究提供菌体材料与工艺数据参考。 方法 基于基因组注释预测碳/氮源利用偏好,并开展实验验证;通过单因素试验确认最适碳源和氮源;随后采用单因素极差效应排序对主要影响因素进行比较分析;最后,利用Box-Behnken响应面设计建立二次回归模型,确定最优工艺参数组合。 结果 单因素试验确认果糖为最适碳源、大豆蛋白胨G为最适氮源;单因素极差效应排序图筛选出果糖浓度、温度和大豆蛋白胨G浓度3个关键影响因素;Box-Behnken响应面建立的二次回归方程( R 2 =0.989 1)预测了有利于提高终点培养浊度( OD 600 )的工艺参数:温度37.6 ℃、果糖1.5%、蛋白胨3.9%。在此条件下2 L液体发酵活菌数达到5.27×10 9 CFU/mL。放大验证结果显示,经200 μL微孔板、100 mL摇瓶和2 L罐体搅拌式发酵罐三级逐级验证,2 L罐体与100 mL摇瓶的培养结果趋势一致。 结论 完成 M . indica 的培养条件优化并在2 L发酵液中进行了初步验证,菌体密度达到5.27×10 9 CFU/mL,为后续工艺探索提供了数据参考。 1 2 3 4 5 6 7 李艳红,卢浩鹏,胡晓云,谭验,朱宁 2026,53(10):5689-5708, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260344 CSTR: 32113.14.j.MC.260344 背景 印度巨球形菌( Megasphaera indica )是从健康人类粪便中分离的专性厌氧革兰氏阴性球菌,基因组分析显示其具有多项特异适应人类肠道的特征(丰富CAZymes、胆汁耐受、多药外排泵),提示其在肠道健康中具有潜在重要作用。然而,目前尚无该菌发酵工艺优化的相关研究,制约了其研究与应用的深入开展。 目的 优化 M . indica 液体发酵工艺,提高其培养密度,为后续研究提供菌体材料与工艺数据参考。 方法 基于基因组注释预测碳/氮源利用偏好,并开展实验验证;通过单因素试验确认最适碳源和氮源;随后采用单因素极差效应排序对主要影响因素进行比较分析;最后,利用Box-Behnken响应面设计建立二次回归模型,确定最优工艺参数组合。 结果 单因素试验确认果糖为最适碳源、大豆蛋白胨G为最适氮源;单因素极差效应排序图筛选出果糖浓度、温度和大豆蛋白胨G浓度3个关键影响因素;Box-Behnken响应面建立的二次回归方程( R 2 =0.989 1)预测了有利于提高终点培养浊度( OD 600 )的工艺参数:温度37.6 ℃、果糖1.5%、蛋白胨3.9%。在此条件下2 L液体发酵活菌数达到5.27×10 9 CFU/mL。放大验证结果显示,经200 μL微孔板、100 mL摇瓶和2 L罐体搅拌式发酵罐三级逐级验证,2 L罐体与100 mL摇瓶的培养结果趋势一致。 结论 完成 M . indica 的培养条件优化并在2 L发酵液中进行了初步验证,菌体密度达到5.27×10 9 CFU/mL,为后续工艺探索提供了数据参考。 牛库布病毒荧光定量 PCR 检测方法的建立与应用 成曼溶,葛欣然,靳宇晴,金钰锦,刘婷婷,刘佳安,孟令品,高峥,宋扬,温树波 2026,53(10):5709-5722, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251343 CSTR: 32113.14.j.MC.251343 摘要: (1) HTML (2) PDF (2.04 M)( 2 ) Abstract: 背景 牛库布病毒(bovine kobuvirus, BKoV)是一种新兴的牛肠道病毒(bovine enterovirus, BEV),可对养牛业造成潜在威胁。该病原在国内尤其是在内蒙古自治区的流行状态尚不清楚,也缺乏针对该病原的商品化检测试剂盒。 目的 建立一种检测BKoV的高灵敏、特异性荧光定量PCR方法,并初步调查其在内蒙古地区腹泻牛群中的流行情况,以期为该病的防控与研究提供技术依据。 方法 基于BKoV 5′UTR保守区序列设计特异性引物,以BKoV阳性样品cDNA为模板进行PCR扩增,并将目的片段克隆至pMD18-T载体,成功构建重组质粒pMD18-T-BKoV。以10倍梯度稀释制备的标准品质粒(1×10 1 -1×10 9 copies/μL)为模板,建立荧光定量PCR标准曲线,并进行特异性、敏感性及重复性评价。 结果 特异性试验表明,所建立qPCR检测方法仅对BKoV产生特异性扩增,与BEV、牛病毒性腹泻病毒(bovine viral diarrhea virus, BVDV)、牛诺如病毒(bovine norovirus, BNoV)、牛副流感病毒3型(bovine parainfluenza virus type 3, BPIV3)及牛环曲病毒(bovine torovirus, BToV)均无交叉反应。标准曲线线性良好( R 2 >0.99),灵敏度达5.08×10 1 copies/μL,是常规PCR检测方法的10倍。重复性良好,组内与组间变异系数(coefficient of variation, CV)均低于1.4%。临床样本验证结果显示,该方法可用于BKoV感染检测,适用于早期快速筛查。对来自内蒙古自治区8个不同盟市的164份临床腹泻样品检测中,检测到阳性样品53份,阳性率达32.3%。采用巢式PCR对所有临床样品进行复核,产物测序并进行遗传进化分析。结果显示,本研究检测获得的序列为BKoV病毒序列,并且与国内报道的BKoV毒株序列亲缘关系较近。 结论 本研究建立的qPCR方法具有高灵敏度、强特异性和良好重复性,为BKoV检测与定量分析提供了可靠技术支撑,在疫病防控和流行病学研究方面具备重要应用价值。 1 2 3 4 5 6 7 8 成曼溶,葛欣然,靳宇晴,金钰锦,刘婷婷,刘佳安,孟令品,高峥,宋扬,温树波 2026,53(10):5709-5722, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251343 CSTR: 32113.14.j.MC.251343 背景 牛库布病毒(bovine kobuvirus, BKoV)是一种新兴的牛肠道病毒(bovine enterovirus, BEV),可对养牛业造成潜在威胁。该病原在国内尤其是在内蒙古自治区的流行状态尚不清楚,也缺乏针对该病原的商品化检测试剂盒。 目的 建立一种检测BKoV的高灵敏、特异性荧光定量PCR方法,并初步调查其在内蒙古地区腹泻牛群中的流行情况,以期为该病的防控与研究提供技术依据。 方法 基于BKoV 5′UTR保守区序列设计特异性引物,以BKoV阳性样品cDNA为模板进行PCR扩增,并将目的片段克隆至pMD18-T载体,成功构建重组质粒pMD18-T-BKoV。以10倍梯度稀释制备的标准品质粒(1×10 1 -1×10 9 copies/μL)为模板,建立荧光定量PCR标准曲线,并进行特异性、敏感性及重复性评价。 结果 特异性试验表明,所建立qPCR检测方法仅对BKoV产生特异性扩增,与BEV、牛病毒性腹泻病毒(bovine viral diarrhea virus, BVDV)、牛诺如病毒(bovine norovirus, BNoV)、牛副流感病毒3型(bovine parainfluenza virus type 3, BPIV3)及牛环曲病毒(bovine torovirus, BToV)均无交叉反应。标准曲线线性良好( R 2 >0.99),灵敏度达5.08×10 1 copies/μL,是常规PCR检测方法的10倍。重复性良好,组内与组间变异系数(coefficient of variation, CV)均低于1.4%。临床样本验证结果显示,该方法可用于BKoV感染检测,适用于早期快速筛查。对来自内蒙古自治区8个不同盟市的164份临床腹泻样品检测中,检测到阳性样品53份,阳性率达32.3%。采用巢式PCR对所有临床样品进行复核,产物测序并进行遗传进化分析。结果显示,本研究检测获得的序列为BKoV病毒序列,并且与国内报道的BKoV毒株序列亲缘关系较近。 结论 本研究建立的qPCR方法具有高灵敏度、强特异性和良好重复性,为BKoV检测与定量分析提供了可靠技术支撑,在疫病防控和流行病学研究方面具备重要应用价值。 基于 ERA/CRISPR-Cas12a 系统的荧光传感平台快速检测鹦鹉热衣原体 覃芳,费嫦,李梓怡,陈丽丽,阳大庆,邓仲良 2026,53(10):5723-5734, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260020 CSTR: 32113.14.j.MC.260020 摘要: (1) HTML (1) PDF (1.76 M)( 1 ) Abstract: 背景 鹦鹉热衣原体( Chlamydia psittaci )是导致鸟疫和鹦鹉热的重要病原体,由于其临床表现不典型,容易出现误诊、漏诊、延误病情和影响治疗。 目的 构建酶促重组等温扩增技术(enzymatic recombinase amplification, ERA)结合成簇规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats, CRISPR)-Cas12a生物荧光传感平台,提供一种敏感、特异、低成本和早期快速检测鹦鹉热衣原体的新方法。 方法 利用CRISPR-DT软件筛选(CRISPR RNA (crRNA)及针对鹦鹉热衣原体主要外膜蛋白(major outer membrane protein, MOMP)序列,利用Primer-Blast设计ERA引物,构建ERA/CRISPR-Cas12a荧光系统,优化crRNA、LbCas12a蛋白及荧光探针等条件,评价系统的敏感性和特异性。收集57例鸟类生物样本,以实时荧光定量PCR为标准,评价ERA/CRISPR-Cas12a荧光系统检测效能。 结果 ERA/CRISPR-Cas12a荧光系统可在40 min内完成检测,该方法的敏感性高,以鹦鹉热衣原体MOMP重组质粒为模板,最低检出限可以达到1 copy/µL;特异性好,与其他病原体无交叉反应。该荧光系统检测57例生物样本DNA,其阳性和阴性预测值为100%,与实时荧光定量PCR法的结果高度一致(κ=1)。 结论 通过ERA结合CRISPR-Cas12a,建立了一种简单、快速、敏感、特异、低成本检测鹦鹉热衣原体的方法,为早期监测并预防鸟疫和鹦鹉热的流行和传播提供一种有效的手段。 1 2 3 4 5 覃芳,费嫦,李梓怡,陈丽丽,阳大庆,邓仲良 2026,53(10):5723-5734, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.260020 CSTR: 32113.14.j.MC.260020 背景 鹦鹉热衣原体( Chlamydia psittaci )是导致鸟疫和鹦鹉热的重要病原体,由于其临床表现不典型,容易出现误诊、漏诊、延误病情和影响治疗。 目的 构建酶促重组等温扩增技术(enzymatic recombinase amplification, ERA)结合成簇规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats, CRISPR)-Cas12a生物荧光传感平台,提供一种敏感、特异、低成本和早期快速检测鹦鹉热衣原体的新方法。 方法 利用CRISPR-DT软件筛选(CRISPR RNA (crRNA)及针对鹦鹉热衣原体主要外膜蛋白(major outer membrane protein, MOMP)序列,利用Primer-Blast设计ERA引物,构建ERA/CRISPR-Cas12a荧光系统,优化crRNA、LbCas12a蛋白及荧光探针等条件,评价系统的敏感性和特异性。收集57例鸟类生物样本,以实时荧光定量PCR为标准,评价ERA/CRISPR-Cas12a荧光系统检测效能。 结果 ERA/CRISPR-Cas12a荧光系统可在40 min内完成检测,该方法的敏感性高,以鹦鹉热衣原体MOMP重组质粒为模板,最低检出限可以达到1 copy/µL;特异性好,与其他病原体无交叉反应。该荧光系统检测57例生物样本DNA,其阳性和阴性预测值为100%,与实时荧光定量PCR法的结果高度一致(κ=1)。 结论 通过ERA结合CRISPR-Cas12a,建立了一种简单、快速、敏感、特异、低成本检测鹦鹉热衣原体的方法,为早期监测并预防鸟疫和鹦鹉热的流行和传播提供一种有效的手段。 基于科研型人才培养的研究生 “ 发酵工程 ” 课程教学改革 何腾霞,丁晨雨 2026,53(10):5735-5748, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251330 CSTR: 32113.14.j.MC.251330 摘要: (1) HTML (2) PDF (1.57 M)( 2 ) Abstract: 在生物技术产业迅猛发展的背景下,为满足新时代对科研型创新人才的迫切需求,对研究生“发酵工程”课程进行了系统性改革。改革以提升研究生科研素养与实践创新能力为核心,通过模块化教学、科研项目进课堂、系统性科研训练及多元化师资共导等创新策略,构建了“基础理论-前沿技术-科研实践”三位一体的课程体系。实践表明,改革有效激发了学生的科研兴趣,增强了独立思考与创新能力,为生物制造领域高水平科研型人才的培养提供了有力支撑。 1 2 3 2026,53(10):5735-5748, DOI: 10.13344/j.microbiol.china.251330 CSTR: 32113.14.j.MC.251330 在生物技术产业迅猛发展的背景下,为满足新时代对科研型创新人才的迫切需求,对研究生“发酵工程”课程进行了系统性改革。改革以提升研究生科研素养与实践创新能力为核心,通过模块化教学、科研项目进课堂、系统性科研训练及多元化师资共导等创新策略,构建了“基础理论-前沿技术-科研实践”三位一体的课程体系。实践表明,改革有效激发了学生的科研兴趣,增强了独立思考与创新能力,为生物制造领域高水平科研型人才的培养提供了有力支撑。 4株茶树根际促生菌菌株的鉴定及促生作用 实时荧光定量PCR中内参基因的选择 抗菌活性海洋真菌HN4-13的鉴定及其发酵优化 草鱼出血病混合感染的嗜水气单胞菌的分离、鉴定与理化特性 云南嵩明大哨天然虫生真菌及其内生真菌的分离鉴定与抑菌活性分析 Clostridium thermocellum与Bacillus licheniformis共培养分解纤维素的性质 土壤细菌DNA提取及多样性分析的T-RFLP方法 黑龙江省水稻穗褐变病病原菌的分离与鉴定 SCI收录的微生物科学期刊信息 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)发酵生产乙偶姻的pH调控策略 以比生长速率时间曲线为基础的生物群体生长数学模型 辅助噬菌体在噬菌体展示中的应用及研究进展 病毒入胞机制研究方法及其研究进展 转醛醇酶基因差异表达影响酵母发酵木糖及耐受乙酸性能 荚膜唾液酸对猪链球菌激活巨噬细胞TLR2-AKT-NF-κB信号通路影响的研究 《微生物学通报》入选卓越行动计划第二期中文领军期刊项目 《微生物学通报》连续12年获得“百种中国杰出学术期刊”称号 《微生物学通报》第十一届编委会第二次会议顺利召开 中国微生物学会第一届动物生物安全“挑战杯”大赛通知 2024年第6期环境微生物学主题刊出版 《微生物学通报》2026年“人体微生物组主题刊/专栏”征稿通知 《微生物学通报》2026年“高等院校教学主题刊/专栏”征稿通知 《微生物学通报》2025年“脱卤微生物学主题刊”征稿通知 《微生物学通报》2025年“兽医微生物学主题刊/专栏”征稿通知 202508光合与自养微生物专栏 202502人兽共患病原菌主题刊 202412创刊50周年主题刊 202406环境微生物学主题刊 202404高等院校教学主题刊 202304环境微生物学主题刊 202212兽医微生物学主题刊 202204高等院校教学主题刊 202107微生物天然产物发现及生物合成主题刊 202011互惠共生微生物专栏 202010环境微生物学主题刊 202009微生物生态学主题刊 202007微生物酶工程主题刊 202004高等院校教学主题刊 201908活性污泥微生物组主题刊 201902微生物遗传学主题刊 201809海洋微生物学主题刊 201803高等院校教学主题刊 201712兽医微生物学主题刊 201707环境微生物学主题刊 201403伴随中国微生物学发展40年 201310放线菌生物学与生物技术专刊
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